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db2db:一个操作简单、覆盖全面的ID转换工具

当你做模式生物的时候,尤其是人和老鼠。一般也不需要ID转换。当你对非模式生物的蛋白质组学数据进行深度的生信分析的时候,很多时候都需要转换ID。

ID转换(UniprotID GeneIDGeneName LocusTag Emsembl ID等等之间的互相转换),除了最为专业的Biomart以外,还有DAVID、Uniprot等。不过Biomart操作略微复杂一些,DAVID数据库太老,转换质量差,Uniprot的ID转换也挺好用,但是其转换主要是偏向于Uniprot本身特色的使用,普适性差,且支持的ID类型并不是很全。这里,介绍一下操作界面简单优化,转换质量高的工具:db2db (biodbnet中的一个模块)。

地址:https://biodbnet-abcc.ncifcrf.gov/db/db2db.php

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  • 原文链接http://kuaibao.qq.com/s/20180228G15ULZ00?refer=cp_1026
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