生信笔记第一期 Circos到底是个什么东西？

摘要：本文主要介绍cirsos的应用和学习思路

关键词：circos、perl

circos是什么？

Circos is a tool to solve problems—it is not itself a solution！

简单来讲，circos是一个perl语言编写的信息视觉可视化软件包，能够以圈图的形式表现出不同目标之间的差异。

我们生物很多用在基因组或者染色体之间的差异，比如说展示一个细菌基因组的构成，这种构成除了长度之外还有GC含量以及功能展示，下面给大家看一张图，比较漂亮的展示了一些信息。

优点

以圈图形式展示信息

灵活性强，可以任意加载数据

颜色亮丽，可以输出矢量图

缺点

需要具备一定的编程能力

对于个人创意要求较高

数据需要预处理

学习方法

虽然这个软件是perl语言写出来的，但比较好的消息是我们不需要具备对于perl本身有太多的了解，就好像很多软件是C写出来的，我们只要用就好了。

也就是说，在学习circos时，跟学习我们普通软件操作类似，只要明白有多少个功能，以及各个功能有什么样的作用，那么随机组合本身就可以产生不错的图。

欢迎你也一起参与到circos学习中来！