术前术后血清cfDNA中KRAS突变是胰腺癌预后的生物标志物（2）

术前术后血清cfDNA中KRAS突变是胰腺癌预后的生物标志物（回顾性研究）

往期回顾

在上期中，我们提到了卡方和Fisher’s精确检验（确切概率法），以及如何比较Kaplan–Meier曲线差异，本文将使用SPSS软件进行详细操作。

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卡方和Fisher’s精确检验的正确使用

上一篇中，我们讲到了卡方检验的使用是有条件的:

1）对于R×C表资料检验

不宜有1/5以上格子的理论频数

由卡方检验的条件，可以看出何时使用Fisher’s精确检验，但实际上，Fisher’s精确检验的能力要比这边说的更强大，Fisher’s精确检验的基本思想是：在四格表的周边合计不变的情况下，用公式直接计算表内四个组合的概率。

严格来说，他不应该是卡方检验的备胎，理论上所有2×2和R×C表，均可使用确切概率法，结果可信，也不受样本量和理论频数的限制，只是由于以往的计算机能力的限制，导致自由度比较大或者样本量比较大的时候，耗时太长，所以才多用于小样本的四格表检验

2）对于2×2的列联表：

（1）当最小理论频数Tmin≥5, n≥40时，直接用Pearson卡方检验；

（2）当1≤Tmin

（3）当Tmin

1、R×C表

①数据整理

②选择Analyze > Descriptive Statistics > Crosstabs..

③交叉表中各个参数的设置

④结果解读

从第一张结果中，可以看出，理论频数都≥5，总例数＞40，可以用卡方检验；第二张结果中，有理论频数都＜5，且超过1/5的各数，应该选择精确检验。

2、2×2表

①-③操作同前

④结果解读

2×2表中，会比R×C表多一项连续修正结果，其对应的是理论频数≥1且＜5，N≥40时使用的。

另外需要强调的是，本质上，以上情况都可以使用Fisher's精确检验的结果！

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比较Kaplan–Meier曲线差异

生存曲线常见的比较方法有Log-Rank（最为常用）和Wilcoxon法（又称为Breslow法）；Log-Rank检验在实际工作中应用较多。

①数据整理（本例是将某基因表达水平按三分位数分为三组）

②选择Analyze→Survival→Kaplan-Meier

③生存分析中各项参数设置

④结果解读

表1. 各组的例数

表2. 生存时间平均值和中位数

生存分析的平均值和中位数表格给出了生存时间估计的结果，显示三组平均生存时间的估计值、标准误和估计值的95%可信区间，以及中位生存时间的估计值、标准误和估计值的95%可信区间。

图1 生存曲线

表3 两两比较结果

参考文献：

1. Nakano Y, Kitago M, Matsuda S et al. KRAS mutations in cell-free DNA from preoperative and postoperative sera as a pancreatic cancer marker: a retrospective study. Br J Cancer. 2018 Mar 6;118(5):662-669

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