文献速递 | Pacbio三代全长转录组测序在动物和医学研究中的应用

1 .基于PacBio全长转录组技术研究人类卵母细胞至胚胎转化的母源mRNA重塑机制

文章标题：Remodeling of maternal mRNA through poly(A) tail orchestrates human oocyte-to-embryo transition.发表期刊：Nat Struct Mol Biol影响因子：18.361中科院分区：1区发表时间：2023.02.30

摘要

在这篇文章中，研究人员利用PacBio全长转录组技术，深入研究了卵母细胞成熟和受精过程中的转录调控。他们发现，聚腺苷酸（poly(A)）尾在母源mRNA的降解和合成过程中起着关键作用。此外，这些调控作用对人类卵母细胞至胚胎转化过程至关重要。这项研究对于了解生殖发育的分子机制和提高辅助生殖技术的成功率具有重要意义。

2 .PacBio全长转录组揭示DIS3L2核糖核酸酶在卵母细胞成熟和女性生育中的关键作用

文章标题：DIS3L2 ribonuclease degrades terminal-uridylated RNA to ensure oocyte maturation and female fertility.发表期刊：Nucleic Acids Res影响因子：19.16中科院分区：1区发表时间：2023.04.24

摘要

这篇研究报告了DIS3L2核糖核酸酶在卵母细胞成熟过程中的关键作用。作者利用PacBio全长转录组技术发现，DIS3L2可以降解尿嘧啶化RNA，这一过程对卵母细胞成熟和女性生育至关重要。这项发现有望为治疗女性生育障碍提供新的治疗靶点。

3 .利用PacBio全长转录组技术探究XAP5 CIRCADIAN TIMEKEEPER对RNA剪接和植物昼夜节律的调控机制

文章标题：XAP5 CIRCADIAN TIMEKEEPER regulates RNA splicing and the circadian clock by genetically separable pathways发表期刊：Plant Physiol影响因子：8.005中科院分区：1区发表时间：2023.03.28

摘要

本文采用PacBio全长转录组技术研究了XAP5 CIRCADIAN TIMEKEEPER（XCT）在植物中对RNA剪接和昼夜节律的调控。研究人员发现，XCT通过遗传可分离途径调控植物生长、发育以及适应环境变化过程中的RNA剪接和昼夜节律。这一研究结果揭示了植物生物钟的分子机制，有助于理解植物对环境变化的响应，并为改良作物品种提供新的研究方向。

参考文献

Liu Y, Zhao H, Shao F, Zhang Y, Nie H, Zhang J, Li C, Hou Z, Chen ZJ, Wang J, Zhou B, Wu K, Lu F. Remodeling of maternal mRNA through poly(A) tail orchestrates human oocyte-to-embryo transition. Nat Struct Mol Biol. 2023 Feb;30(2):200-215. doi: 10.1038/s41594-022-00908-2. Epub 2023 Jan 16. PMID: 36646905; PMCID: PMC9935398.

Wu D, Pedroza M, Chang J, Dean J. DIS3L2 ribonuclease degrades terminal-uridylated RNA to ensure oocyte maturation and female fertility. Nucleic Acids Res. 2023 Apr 24;51(7):3078-3093. doi: 10.1093/nar/gkad061. PMID: 36727488; PMCID: PMC10123098.

Zhang H, Kumimoto RW, Anver S, Harmer SL. XAP5 CIRCADIAN TIMEKEEPER regulates RNA splicing and the circadian clock by genetically separable pathways. Plant Physiol. 2023 Mar 28:kiad193. doi: 10.1093/plphys/kiad193. Epub ahead of print. PMID: 36974904.