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差异分析的结果可视化分析作图教程

基因表达的热图绘制

根据所有差异基因绘制基因表达的聚类热图

绘制top差异基因表达的聚类热图

绘制感兴趣基因的聚类热图

差异分析结果的火山图绘制

高中低差异表达分类着色的火山图绘制

差异分析火山图可视化,func_color_type参数值为categorical可绘制高中低差异表达分类着色的火山图

高中低差异表达渐变着色的火山图绘制

差异分析火山图可视化,func_color_type参数值为continuous可绘制高中低差异表达渐变着色的火山图

在火山图中标记出一组感兴趣的基因

差异分析火山图可视化,func_mark_target_genes参数的值为:hsa-miR-155-5p;hsa-miR-34a-5p;hsa-miR-122b-3p,可以在火山图把这三个miRNA的名字单独标记展示出来

对多个差异分析结果文件批量绘制火山图

要批量绘制火山图的三个转录组差异分析结果文件列表

批量绘制出的三个火山图:

一组感兴趣的基因的表达量展示和差异比较的可视化

3.1 一张图中绘制一组基因表达水平的箱式图

3.2 对一组基因每个基因单独绘制一张箱式图

3.3 一张图中绘制多个基因的试验vs对照的差异箱式图,手动输入一组基因

3.4 一张图中绘制多个基因的试验vs对照的差异箱式图,提供一个基因列表文件

3.5单个基因的多类别的试验vs对照差异箱式图

  • 发表于:
  • 原文链接https://page.om.qq.com/page/ONkD0Hr-2wvAMOl_TgQmbwkA0
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