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直接指导荧光分子设计,浙大等提出模块化人工智能框架FLAME

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编辑丨coisini

荧光成像作为基础研究和临床实践不可或缺的工具,其发展一直受荧光团技术所驱动。现有荧光团普遍存在性能不足的问题,且由于微妙的构效关系与复杂的溶剂效应,其开发过程高度依赖试错实验。

近年来,基于机器学习的数据驱动科学在预测分子性质、虚拟筛选和分子生成等领域展现出巨大潜力。就荧光分子设计而言,需同步考虑最大吸收波长、最大发射波长、光致发光量子产率和摩尔吸光系数等复杂关联参数。

近期,来自浙江大学等机构的研究者构建了模块化架构的人工智能框架 FLAME,通过整合开源数据库、多重预测模型与前沿分子生成器来革新荧光团设计。研究论文以《A modular artificial intelligence framework to facilitate fluorophore design》为题发表在《Nature Communications》上。

论文地址:https://www.nature.com/articles/s41467-025-58881-5

首先,该研究创建了迄今最大的开源荧光团数据库 FluoDB,包含 55,169 个荧光团 - 溶剂配对样本。相较于现有数据库,FluoDB 在数据量与分子多样性上均有突破,涵盖 16 类核心荧光骨架和 728 个亚类。

研究团队进而设计出基于「荧光骨架」指纹表征的光学性能预测模型 FLSF,该模型能快速精准地预测光学性能,其可靠性与潜力已通过分子和原子层面的可解释性分析得到验证。进一步整合分子生成器后,该框架可设计具有目标荧光特性的新型化合物。

为了直接指导荧光分子设计,研究团队整合多种开源数据库、预测模型和分子生成器,构建了人工智能框架 FLAME,并用实验验证了其实用性。研究团队从虚拟分子库选择 3,4 - 噁唑并香豆素分子,利用一锅法合成了高亮度新型荧光分子。

FLAME 能帮助研究人员高效设计具有预期光学性能的全新分子:研究人员仅需向系统输入目标光物理参数,即可自动完成多步骤计算流程,大幅减少试错实验负担,且研究人员无需具备荧光或计算领域的专业知识。

得益于模块化架构,FLAME 可持续整合新数据 / 算法,以实现迭代升级。研究团队表示:未来 FLAME 还可引入合成可行性预测模型对候选分子进行可合成性评分,并集成逆合成分析工具,实现从分子设计到合成路线的全流程优化。

相关报道:http://www.news.zju.edu.cn/2025/0421/c777a3040425/pagem.htm

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