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干货:BRCA1基因+OMIM数据库=?

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OMIM数据库简介

19世纪60年代早期,Dr. VictorA. McKusick发起建立人类孟德尔遗传的知识库,通过书籍出版的方式传播孟德尔遗传的表型性状和基因的知识,该书通过多次更新再版,最后在1995年,NCBI将纸质的知识库开发成了在线网页版的形式,也就成了今天大家所看到的OMIM(网址见文末)。

OMIM,全称Online Mendelian Inheritance in Man(在线人类孟德尔遗传), daily更新,截止2018年5月11日共收录了24545个词条,主要包括15885个基因词条和5242个已知分子机制的表型词条。

OMIM号左上角标记的含义

*代表基因,例如* 113705;

+代表基因和表型组合,例如+100650;

#代表已知分子机制的表型,例如#604370;

%代表未知分子机制的表型,例如%100070。

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以BRCA1基因为例介绍OMIM数据库的使用

由于携带BRCA基因的突变,为降低罹患癌症的风险,安吉丽娜朱莉相继切除乳腺和卵巢,将遗传性肿瘤预防和检测推到了舆论的风口浪尖。BRCA基因,也由此成为了”明星“基因。那么对于临床医生,基因解读人士以及各种好学宝宝如何快速,深入,了解,BRCA基因背后的,基本科学理论知识呢?

第一步:在搜索框内输入BRCA1(不区分大小写),来到*113705词条的页面

在这个词条中间的有BRCA1基因的全称BREAST CANCER 1 GENE,以及HGNC认证的基因名(ps:因为有些基因有别名),染色体位置,基因的物理位置等。下面表格显示和基因对应表型的MIM号、遗传模式和个数。

页面左侧显示整个页面的小标题,常用的部分可包括Text的Description(基因描述)、Cloning and Expression(克隆和表达)、Gene Structure(基因结构)、Gene Function(基因功能)等,大家可以根据实际需求点击小标题的字条查找。例如,Description显示BRCA1在DNA修复、细胞周期调控和维持基因组的稳定性方面发挥重要作用;Gene Structure显示早在1994年研究发现BRCA1基因是120kb的DNA片段,有22个外显子,附带有参考文献

页面右侧显示外部关于BRCA1基因的网址,惊奇的是,每个小标题点开都有相应的网址的链接,真的很实用,有木有。

第二步:点击表格里的604370,跳转到乳腺癌-卵巢癌,家族型,1型的表型的页面,这个页面的知识简直不要太全呀。

同样的,在这个页面的左侧显示页面outline,包括ClinicalFeatures(临床表型特征)、Inheritance(遗传模式)、Molecular Genetics(分子机制)、Clinical Management(疾病临床管理)等等。例如,右侧显示外部关于此疾病的链接,这些链接的好处是有时在OMIM数据库不全的信息在外部链接中会找到。

本期内容主要介绍了OMIM数据库,并以BRCA1基因为例进行介绍,OMIM数据库的网址为:https://www.omim.org/

如果觉得有帮助,希望动动手指点个赞呀。

  • 发表于:
  • 原文链接https://kuaibao.qq.com/s/20180723G10HKJ00?refer=cp_1026
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