关于秩和检验那些事

本方法依赖于王秦虎写的R包aid，网址为https://github.com/wangqinhu/aid

首次使用需要做的一些准备工作，第二次用的时候不再需要重复操作：

首先电脑需要安装最新版的R及Rstudio软件，下载地址是：

R： http://mirrors.ustc.edu.cn/CRAN/

Rstudio：https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/

默认设置安装就好。

安装成功后，我们需要安装本分析用的R语言包aid包

首先在Rstudio命令行输入界面中，输入install.packages(“devtools”)

待安装完成后，输入：library（devtools），回车；

然后再输入install_github(repo ="wangqinhu/aid")，回车。

至此，所有准备工作完成。

注意：命令行请不要复制粘贴，请在英文输入法的情况下键盘手动敲入

首先将自己的数据整理成如下格式：

最左上角为一个空格，最左边一列是不同株系的名称，最上面一行为不同的发病等级，数值与数值之间用tab间隔开，也可在excel中做成上面的格式，直接粘贴到txt文本文件中，默认为tab键隔开。将整理好的文本保存到D盘根目录下，保存文字为1.txt。文本路径为“D:/1.txt”

注意：第一行一定要是对照，即你所有的植株跟谁比就把谁放到第一行。

2. 打开Rstudio，输入命令行library(aid)，按回车键，然后输入命令行aid("D:/ 1.txt",type = "grade", alternative="two.sided", paired=FALSE)，然后就会得到下图：

命令行中的alternative=“two.sided”可以根据需要修改为“greater”或者“less”，two.sided是双边检验，“less”和“greater”是单边检验，大家可以根据自己的实验需要进行修改。

上面的第二行代表差异显著性，有星号的表示有显著性差异，一个星号是p-value

3 然后点击右边的export按钮

三个选项均可选择，保存为图片中可以设置图片的保存格式及大小，自己可以根据需要设置图片的保存格式及长宽比例。

由于该脚本不能设置文字的大小，有可能保存的图片并不能符合发表需要，这就需要用Adobe illustrator软件对其进行局部修改。

注意：假如病害等级大于四级后，就会出现如下情况：

就是最右边的图例显示不完全。

这种情况就需要将自己的图片导出为pdf格式的文件，然后用Adobe illustrator进行局部修改。