The Fiehn library
The Fiehn library(FiehnLib)数据库中含有超过2200个EI质谱图和RIs,这些信息来源于大于1000个分子量在550Da的代谢物,覆盖了包括脂类、氨基酸、脂肪酸、胺类、醇类、糖类、氨基糖类、糖醇类、糖酸类、有机磷酸盐类、羟基酸类、芳香类、嘌呤类和甾醇类等化学标准品的甲基化和硅烷化的EI质谱图。
FiehnLib包含了两个分别使用四极杆和TOF质量分析器检测的数据库。FiehnLibAgilent数据库使用单四极杆作为质量分析器,在全扫描模式下获取了质荷比范围在50到650之间的化合物的质谱图。FiehnLib LECO则使用TOF检测器获取了分子量在85到500之间的化合物的质谱图。在这两种情况下都使用了脂肪酸甲酯作为RI标记物。由于很少的实验室使用脂肪酸甲酯作为RI标记物,因此需要使用复杂的计算方法将其转换回常见的Kovats RI。FiehnLib数据库可以与一些商业软件(如安捷伦的ChemStation或LECO的Chroma TOF软件)结合使用。此外,FiehnLib LECO还可以与SetupX/BinBase数据处理系统联合使用,获得的结果还可以通过网络进行下载。
代谢组学中常见数据库的优缺点
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