MNE-Python环境配置

在前一段时间,给大家推荐了使用MNE-Python软件来分析EEG数据,上次有人留言说环境配置问题,我最近在学习这个,我将我配置的方法告诉给大家,希望你也能运行起来。更多的问题可与我联系,并且可在mne的问题网址上寻找答案,亦或者是邮件订阅mne列表。

工具材料:

1、Anaconda软件,配置Python运行环境

指导网址:

1、Anaconda官方window系统下安装网址:https://docs.anaconda.com/anaconda/install/windows

2、MNE-Python安装指导网址:https://martinos.org/mne/stable/install_mne_python.html

安装步骤:

1、Anaconda软件安装,anaconda是作为python3运行环境的软件,在安装步骤下可参考官方网址的步骤,这个不难。唯一要注意的界面,

勾选上Register Anaconda as your default Python 3.6,这样就可以在Py3以上版本运行mne了。

***2、开始配置MNE-Python环境:

在window开始菜单栏中找到anaconda运行的命令窗Anaconda Prompt

然后根据MNE-Python网址上的步骤在Prompt上依次输入一下命令行:

由于我已经配置好了MNE环境,我就不再运行以下关键的命令行:

curl -O https://raw.githubusercontent.com/mne-tools/mne-python/master/environment.yml

# 这是安装官方人员已经配置好的python环境库

conda env create -f environment.yml

#创建Anaconda的MNE环境

activate mne

#激活MNE运行环境

deactivate

#退出MNE运行环境

查看是否已配置完成,在MNE环境下输入Python-import mne,如果不报错则配置完成。

这种方法是最简单也是最方便的,但是可能是你在配置下载第三方库时,会由于网络差的原因造成报错而无法安装,这是普遍存在的。所以我还推荐离线安装第三方库的方法,根据mne需要配置的环境第三库来安装,这种方法比较繁琐,但也是有效的方法,**在创建的mne环境下,运行pip或者conda命令安装以下库,我个人建议是使用pip install "name"比较快。

配置好后,可在Anaconda Prompt中使用命令conda list查看已安装的库或者打开Anaconda Navigator可在environment查看到配置的mne环境

至此,配置完成。接下来你就可以开始运行官网给出的demo示例以及分析E/MEG数据了。祝好~

比如官网示例中运行相干性代码可展示出可视化图像

可分析的数据格式:

主要参考:anaconda官网以及MNE-Python官网

文章仅限学习使用,不用于商业行为,若有侵权及疑问,请后台留言!

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  • 原文链接https://kuaibao.qq.com/s/20180822G0O5GX00?refer=cp_1026
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