R语言学习-入门环境Rstudio

R语言是比较常用的统计分析和绘图语言,拥有强大的统计库、绘图库和生信分析的Bioconductor库,是学习生物信息分析的必备语言之一。

Rstudio是编辑、运行R语言的最为理想的工具之一,支持纯R脚本、Rmarkdown (脚本文档混排)、Bookdown (脚本文档混排成书)、Shiny (交互式网络应用)等。

Rstudio版本

Rsdutio分为桌面版和服务器版,桌面版可以在单机使用,服务器版可以从浏览器访问供多人使用。

服务器版安装好之后,访问地址为,用户名和密码为Linux用户的用户名和密码。

Rstudio安装

R安装

Linux下安装

Rstudio安装前需要安装R,如果使用的是新版的操作系统。直接可以用 或者来安装。

若系统版本老,或没有根用户权限,则需要下载编译源码安装,最新地址为https://cran.r-project.org/src/base/R-3/R-3.4.0.tar.gz。

具体编译方式为 (Linux下软件安装见 http://blog.genesino.com/2016/06/bash1):

Windows下安装

下载https://cran.r-project.org/bin/windows/双击就可以了。

Rstudio安装

Linux下安装服务器版

安装参考https://www.rstudio.com/products/rstudio/download-server/

安装完之后的检测、启动和配置

Rstudio日志目录,方便查看错误信息:/var/log/rstudio-server/

配置文件:

Timeout

/etc/rstudio/rserver.conf

/etc/rstudio/rsession.conf

Windows下安装桌面版

下载之后 (https://www.rstudio.com/products/rstudio/download2/)双击安装,需要使用管理员权限,其它无需要注意的。

Rstudio 使用

Windows下桌面版直接双击打开即可使用,Linux服务器版访问地址为,用户名和密码为Linux用户的用户名和密码。

Rstudio 界面

Rstudio中新建或打开文件

如果是桌面版,直接就可以访问”我的电脑”去打开之前写过的脚本。如果是服务器版,可直接访问服务器上写过的脚本。Rstudio右下1/4部分可以切换目录,点击more,设置工作目录。可以上传本地的脚本到对应目录打开。

Rstudio还有其它的功能,不过这些对我们初学使用已经足够了。以上简单额举几个画图的例子,后续会根据需要推出基于ggplot2作图的R入门介绍。

Reference

我的GitHub http://blog.genesino.com//2017/06/R-Rstudio

https://support.rstudio.com/hc/en-us

我的CSDN http://blog.csdn.net/qazplm12_3/article/details/73785102

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  • 原文链接https://kuaibao.qq.com/s/20180904B0CJ3000?refer=cp_1026
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