RNA-seq项目结题了,文章在NAR上发表了。Denovo项目结题了,文章在NEW PHYTOL上发表了。GWAS项目结题了,文章处于审稿阶段....。今年科室真是硕果累累,包揽了多个奖项,年底奖金肯定少不了。
回到课题组、实验室,发现七八个硬盘的数据锁在柜子里,问题来了:
1、Ciclev10010164m.v1.0这个基因发生了3 prime UTR variant突变,我想查一下这个基因的功能注释信息,怎么办?
2、想确定一下LOC_Os01g08570基因在不同实验处理条件下,表达量的差异情况,怎么办?
3、想把LOC_Os01g08570这个基因的蛋白序列提取出来,做个Blast比对分析,怎么办?
4、好基友想基于我的样本数据做比较分析,1T的数据只能硬盘邮寄吗?
---直接在windows环境下打开?可以吗?
---你敢吗?试试吗?(友情提示:把其他正在打开的文档,浏览的重要网页保存、存档哦。 你右键,点击“打开”,可能出现......你懂的)
难道不懂编程,这文件大小几十G 或 几百G,甚至几个T的数据,再次使用都会变成一种奢望吗?难道它们要像垃圾数据一样永远躺在硬盘中吗?
不会的,部署一个定制化数据库,所有的问题迎刃而解。
什么是定制化数据库?那就让小编给您详细讲解一下定制化数据库吧!
定制化数据库介绍
❖百迈客云定制化数据库是为用户搭建的一套针对种质资源&基因组学&群体等组学数据的存储、管理、查询、分析的综合性数据库系统。
❖定制化数据库采用模块化设计,用户基于各自研究需求选择特定的模块组合后,便可快速将该模块组合部署于用户本地服务器或百迈客云集群上。
❖该数据库的搭建旨在替代传统的硬盘零散存储+数据手动搜索的原始数据管理模式,提高用户对大规模多组学数据的管理与分析能力。
❖共享研究成果,提升国内相关领域整体研究水平。
❖可作为单独成果发表SCI论文。
看看小编整理的部分数据库发表的文章(篇幅有限,无法一一列举)
数据库核心功能介绍
对定制化数据库产品有了简单的了解后,来看看我们部署的数据库中的部分功能吧!
❖变异数据的检索
可在特定参考版本上,通过特定区域、或特定基因、或特定变异ID完成SNP/Indel的检索。 再也不会出现几十个G的vcf文件中无法查找变异信息的局面了。
❖表达量数据的可视化展示
部署Expression Visualization工具,将基因在各样品不同实验处理条件下的表达量通过热图的形式直观的展示出来。
❖共表达网络图
基于基因间表达数据的相似性而构建的网络图,分析基因产物可能的相互作用关系,从而了解基因间相互作用脉络及寻找核心基因。
❖空间地理信息
从国家、省份、经纬度等多个方向对感兴趣的品种的表型数据进行检索,并且给出品种在世界地图上的分布。
❖便捷的后台管理系统
1、设计了数据后台管理模块,不需要精通IT、运维、美工的全能型人才,只需要对生物有简单的了解即可完成页面文字、图片、底层数据的增、删、改操作。
2、为了保证数据的安全性,后台管理模块可以对不同的数据区块设置不同的使用权限。
成功案例
专业的开发团队
做好一个产品,不可能一个人完成所有的东西,产品从开发到发布都是各个角色合作完成的。 我们可是有专业团队的哦!产品经理会对需求进行分析采样,整理,并制作出交互原型,将原型交付给设计,UI设计师将网站效果设计好后,交付给前端工程师,前端工程师将效果图通过相关动效代码优化提升用户视觉体验后,将成型的代码交互给后端开发人员,后端开发人员将网站进行模板嵌套,形成可以通过域名访问,由测试工程师进行产品测试后,交给项目管理者。
现在大家是不是对定制化数据库有了简单的了解了,这么强大的数据管理功能,是不是可以发一篇不错的文章啊。
不要再让你存储数据的硬盘在角落中落灰了,部署一个定制化数据库吧,不但实现多组学数据的高度整合,还可以再贡献出一篇文章哦。
如果您有更多的疑问,请关注百迈客云公众号,接下来的几期小编将为您详细讲解的。
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