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12个ggplot2扩展包帮你实现更强大的可视化

ggplot2 Extension

转自:生信宝典(Bio_Data),不一样的生信学习平台。

ggplot2自从2007年推出以来,成为世界范围内下载最频繁、使用最广泛的R包之一。许多人包括ggplot2的创建人Hadley Wickham将这一成功归功于ggplot2背后的哲学。这个软件包的灵感来源于Leland Wilkinson编写的《图形语法》一书,在此书中将graphs分解成scales和layers,并将原始数据与表现形式分离开。

1

gganimate

作者:David Robinson

网址:https://www.rdocumentation.org/packages/gganimate 或 https://github.com/thomasp85/gganimate (新版)

简介:gganimate可以使图片以更加生动形象的动图展示出来,可以直观展示数据的动态变化过程,最后我们可以将动画保存为GIF、视频或动画网页,以便在RStudio或笔记本之外使用。如下面这个例子以动态图展现了历年来

诺贝尔获奖者出生地的变化情况

,《利用gganimate可视化全球范围R-Ladies(R社区性别多样性组织)发展情况》一文中有更详细的事例展示如何使用此包。

2

ggthemes

作者:Jeffrey B. Arnold

网址:https://www.rdocumentation.org/packages/ggthemes

简介:ggthemes主要作用是提供一些额外的themes、geoms、scales可以让我们快速画出不同主题、背景和配色方案的图片。学术图表基本配色方法

3

ggpubr

作者:Alboukadel Kassambara

网址:https://www.rdocumentation.org/packages/ggpubr

简介:要通过ggplot2定制一套图形,尤其是适用于杂志期刊等出版物的图形,对于那些没有深入了解ggplot2的人来说就有点困难了,而ggpubr可轻松绘制出符合出版物要求的图形。

4

patchwork

作者:Thomas Pedersen

网址:https://www.rdocumentation.org/packages/patchwork

简介:平常我们绘制图形的时候常常要将几幅图形组合在一起,而ggplot2本身没有强大的拼图语法,这时利用patchwork扩展包,使用几个简单的如、、、等符号就可以轻松实现拼图这件事。还有其它包也可以做类似事情,具体见ggplot2学习笔记之图形排列。

5

ggridges

作者:Claus O. Wilke

网址:https://www.rdocumentation.org/packages/ggridges

简介:ggridges包主要用来绘制山峦图。尤其是针对时间或者空间分布可视化具有十分好的效果。

6

ggdendro

作者:Andrie de Vries

网址:https://www.rdocumentation.org/packages/ggdendro

简介:ggdendro有几个函数可用来提取树状图数据,可以保存或操作数据本身。旋转你的树状图、删除网格背景、倒转,画三角线段,创建和聚类图,等等。结合和包来完全控制你的树状图。

7

ggmap

作者:David Kahle

网址:https://www.rdocumentation.org/packages/ggmap

简介:ggmap包整合了四种地图资源,分别是、、,它使gplot2的所有geoms都可以用于地图可视化,可以在地图上绘制等高线图散点图

8

ggrepel

作者:Kamil Slowikowski

网址:https://cran.r-project.org/web/packages/ggrepel

简介:当我们在图形中添加标签时,标签之间很容易相互重叠,ggrepel包可以解决这个问题,具体见ggrepel使用。

9

ggcorrplot

作者:Alboukadel Kassambara

网址:https://github.com/kassambara/ggcorrplot

简介:ggcorrart是受包的启发,但它的构建是为了与ggplot2一起使用,这就意味着有很多东西可以让我们控制矩阵的外观,从改变颜色、形状或大小(如下面的圆形矩阵),到添加系数标签,根据层次聚类重新排列矩阵等等,具体见ggcorplot使用。

10

ggradar

作者:Ricardo Bion

网址:https://github.com/ricardo-bion/ggradar

简介:雷达图又叫戴布拉图、蜘蛛网图,通常在财务报表分析中使用较多。但在描述性统计分析中,雷达图正在被越来越多的人使用,适用于显示三个或更多的维度的变量。

11

GGally

作者:Barret Schloerke

网址:http://ggobi.github.io/ggally/

简介:GGally汇集了几个有用的可视化功能来扩展ggplot2,包括配对图矩阵散点图矩阵平行坐标图生存图,以及绘制网络的几个函数。可以使用GGally快速绘制模型的系数,或者在地图上绘制网络,如下面的图片所示。

12

ggiraph

简介:ggiraph可以给图片添加高级交互或动画,可以扩展现有的ggplot2条形图、散点图、方框图、地图等,并在悬停时显示数据信息(例如数据值或标签),如下图所示。

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  • 原文链接https://kuaibao.qq.com/s/20190106B0BKGG00?refer=cp_1026
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