R语言编程艺术 第1章 快速入门

今天是生信星球陪你的第258天

大神一句话,菜鸟跑半年。我不是大神,但我可以缩短你走弯路的半年~

就像歌儿唱的那样,如果你不知道该往哪儿走,就留在这学点生信好不好~

这里有豆豆和花花的学习历程,从新手到进阶,生信路上有你有我!

新的开始。其实手头事情很多,想着要不结束后再开始?可是,忙完这阵,也不过是忙下一阵而已,择日不如撞日,就今天。发文临近12点,没赶上。干脆悠然选了个封面图~~~走啦。

1.R语言运行

交互模式

常规的session,用source("z.R")运行脚本

批处理模式

在linux命令行运行 R CMD BSATCH z.R

(计算,小函数,赋值,内置数据集作图)

2.函数

oddcount()计算整数向量中奇数的个数

(1)小知识点

取整 ,取余 ,

行首的大于号和加号,

for循环和k=k+1,

注意代码简洁,可以不写下标

函数中的return:没有显式调用return()时,R语言的函数会返回最后计算的值,不写需谨慎)

函数的作用域

{}内是函数体,里面的n、x都是局部变量,在函数体外无效

(2)关于参数

定义函数:

调用函数:

形参和实参:12是x的实际参数,接受了默认参数y,覆盖了参数z。

默认参数:y的初始化值是2。

3.数据结构

(1)向量

向量必须术语某种“模式”,即数据类型mode(),比如整数型、字符型

字符串实际上是字符模式(而不是数值模式)的单元素向量。

字符串的拆分和组合:paste和strsplit

(2)矩阵

例:

矩阵乘法:

取子集,提取子矩阵

(3)列表

值的容器,其中的值可以属于不同的数据类型。

组件(组成部分),以

str代表structure(结构)。这个函数可以显示任何R对象的内部结构,不只限于列表。

(4)数据框

通常通过读取文件和数据框来创建。是特殊的列表,可以通过开头。作图是有返回值的,返回列表¨G3Gstr代表structure(结构)。这个函数可以显示任何R对象的内部结构,不只限于列表。¨K15K通常通过读取文件和数据框来创建。是特殊的列表,可以通过调用列。

(5)类

R语言是一门面向对象的编程语言。对象是类的实例。

4.扩展

读取--read.table,默认header=FALSE

class-查看类型,head,查看前几行。

lm(y~x)函数,拟合预测方程:y=β0+β1×x

lma

5.获取帮助

(1)help()

help(seq)

快捷方式

?seq

?"for"

(2)example()

运行示例代码

(3)不清楚要找什么

(4)其他主题的帮助

整个包的帮助文档:

help(package=MASS)

主题搜索

(5)批处理模式帮助

R CMD command --help

R CMD INSTALL --help

6.互联网资源

R语言主页(http://www.r-project.org/)

R语言主页(http://www.r-project.org/)

CRAN(R语言综合资料网,网址为http://cran.r-project.org/)

简书:小洁忘了怎么分身

隔壁生信技能树公益视频合辑(学习顺序是linux,r,软件安装,geo,小技巧,ngs组学!)

国内看B站,教学视频链接:https://m.bilibili.com/space/338686099

国外看YouTube,教学视频链接:https://m.youtube.com/channel/UC67sImqK7V8tSWHMG8azIVA/playlists

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  • 原文链接https://kuaibao.qq.com/s/20190124G018II00?refer=cp_1026
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