古奥整合数据库帮你打理科研大数据

基因蛋白千千万，到底研究哪一个？很多小伙伴都不知道怎样开展自己的课题，没方向，没思路，还一看文献就头晕。终于在师兄师姐的帮助下，获得了某个感兴趣基因，你要做的还是开始NCBI/UCSC文献查询和学习的漫漫之旅。有没有一个工具，可以帮助你基因搜索直观理清研究思路呢？原来真有这么一个神器，古奥整合数据库，你要不要试一试？

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整合数据库初识

目前，古奥已经建成大豆、烟草、番茄、斑马鱼等多物种整合库，以物种为单位，每个物种建立一个单独的整合库，将海量的生物学数据进行汇总，提供一个强大的数据信息平台。

图1、多物种数据库

强大的一键式检索功能关联了基因组、转录组、性状等多组学数据，支持目标基因ID、功能、兴趣染色体区域、兴趣性状、组织等多层面检索方式，数据全面，查阅方便。

图2、大豆整合数据库示例图

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如何使用整合数据库

无论你是对某个目标基因感兴趣，还是对某个染色体比较关注，是对一个功能比较感兴趣，还是对某个性状或组织比较在意，你都可以通过搜索框便捷的获得全面准确的信息。

我们以搜索ATP酶功能相关基因为例，查看可能具有调控作用的相关基因。

第1步：关键词初步搜索

选择“Search By Gene Function/Name”，输入关键词“ATPase”，点击搜索，共得到271条相关结果。你可以直接点击基因ID来查看基因详情，但如果你觉得搜索结果过多，可以进行高级搜索或者排序功能；

图3、搜索ATPase示例

第2步：高级搜索

通过高级搜索，进一步筛选相关基因。你可以对更感兴趣的组织、表达量、SNP、INDEL、QTL等信息进一步设置并筛选，简单勾选心仪的条件后，再次搜索，结果大大精确，只剩16条信息；

图4、高级搜索示例图

第3步：排序功能

如果你还觉得相关基因比较多，还可以通过排序功能，选择条件使用独特的打分机制进行相关性排序，将重要性进行排序。位于前列的相关基因将引起你的足够关注了。

图5、排序功能示例图

第4步：查看基因详情

通过以上步骤获得了目标基因后，点击可查看该基因详情，包括基本信息、参考序列、基因结构、基因注释、基因家族、同源基因、表达、变异、QTL数据、调控网络、共表达网络等，一键化获得综合信息，极大的提高了科研效率。

图6、基因详情示例图

第5步：组学数据关联

初步了解目标基因基本属性后，可进一步跳转QTL、基因表达量、SNP/INDEL三大子库，从不同层面对该基因进行了解，帮助理清思路，激发你的科研热情。

图7、三大子库一键跳转

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整合数据库独特优势

（1）多组学信息整合查询

以基因为线索一键查询基因多态性、时空表达及QTL定位相关数据；

（2）快速筛选目标基因

通过大数据筛选检索，结合变异、表达、表型信息缩小目标基因筛选范围；

（3）个性化定制

个性定制满足你的个性需求。