西澳大利亚大学(UWA) DNA动物园计划获得微软公司的一项资助,该项目旨在帮助保护100多万种濒临灭绝的动植物物种。
DNA动物园是一项全球倡议,涉及8个国家的55多名合作伙伴。作为该倡议的一部分,UWA是澳大利亚收集、测序和分析动物DNA的领先机构。
这笔资金将被DNA动物园用于开发利用scat检索无人机(SRDs)收集澳大利亚40多只濒危哺乳动物基因组样本的概念,然后利用微软云计算使基于DNA的物种监测分析民主化。
通过DNA动物园项目收集的样本将是开放源码的,因此它可以与其他开放源码数据集成,并应用机器学习技术,让研究人员能够寻找一些模式,解释为什么一些动物似乎能够茁壮成长,从而减缓或逆转濒危物种的衰落。
例如,这些洞见可能有助于解释为什么短尾矮袋鼠在罗特内斯特岛茁壮成长,而在大陆却举步维艰。
UWA副教授兼澳大利亚DNA动物园的负责人帕温德尔·考尔说,使用微软云计算、人工智能和机器学习技术将有助于自动分析基因组序列。
“这是一个典型的大数据挑战。单个哺乳动物的基因组可能达到3.2 GB。为了正确理解基因组,它需要被读取50次,这对单个动物造成了172 GB的数据挑战。把这个挑战扩大到整个濒危物种种群,计算和分析问题的规模就很明显了。”
UWA是微软“人工智能支持地球”项目的最新接受者。今年4月,这家科技巨头宣布,它为该项目下的其他6个澳大利亚项目提供了支持,其中5000万澳元由莫纳什大学(Monash University)、格里菲斯大学(Griffith University)、昆士兰科技大学(Queensland University of technology, QUT)、InFarm、澳大利亚野生动物保护协会(Australian Wildlife Conservancy)和澳大利亚丛林遗产基金会(Bush Heritage Australia)共同出资。
“快速行动的必要性在澳大利亚已经强化了最近的环境挑战包括扩展干旱,在塔斯马尼亚岛和维多利亚dry-lightning引发山火,全国高温记录,汤斯维尔的洪水造成的破坏,农业在高端的暴雨和洪水在一夜之间气温低,”微软宣布资金时在一篇博客中写道。
西澳大利亚州的一个单独的恢复项目正在使用无人机实时跟踪濒危的带条纹和红色的野兔小袋鼠,这些小袋鼠在过去两年中被重新引入德克哈托格岛国家公园,作为1616年生态恢复项目的一部分。
它消除了传统的地面跟踪的需要,这证明是费时和劳动密集型的,这也意味着科学家可以快速和安全地搜索困难的地形和大面积。
“无人机的使用绝对改变了西澳州偏远地区的保护格局。通过同时监测多种哺乳动物,德克哈托格岛上的科学家们可以更快、更有效地帮助衡量重新引入濒危野生动物的成功程度。”
这让他们有更多的时间集中精力恢复1616年的生态恢复计划,该计划已经消灭了岛上的野猫、绵羊和山羊。”
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