treeio支持解析MEGA的输出

MEGA做为进化界常用的软件，虽然我自己没用过，还是需要支持一下的，它的输出有三种，newick, nexus和tabular，Newick自然不在话下，NEXUS同样也是，当然它也是非标准的NEXUS，跟BEAST的输出比较像，treeio也支持。最后就是tabular了，它实质上是把树的信息导出为表格，方便用户在excel中查看。而我要做的，就是把表格中树相关的信息，变成一个phylo对象，而相关的数据信息，整合在一起变成一个treedata对象。

假设有以下一个表格：

用最新的read.mega_tabular函数读进来是这样子滴：

一个表格，树和数据都有了。

当然假如你喜欢的话，树和数据是分分钟可以变成表格的，只需要使用tidytree包。

有treeio的解析，当然这些信息就少不了可以使用ggtree进行可视化。

三个包的联合，照顾到进化树的解析、输出、操作和可视化的方方面面，恰巧都是我写的。

最搞笑的是MEGA输出newick, nexus和tabular三种格式的树文件，然后自己的输出只能读newick一个。我也是很服气的。