Google与DNAnexus 合作 基因组变异分析更准确

近日,美国生物信息公司 DNAnexus 表示,他们已经整合 Google 的人工智能(AI)深度学习工具 DeepVariant 进入他们的核心基因组信息平台,并进行前导测试(pilot testing),为确定其整合平台之可行性,并借此检讨未来整合平台可改善之处,以避免花费大量人力物力,却获得不佳品质。

DeepVariant 由 Google 公开发表,它主要收集下一代测序(next-generation DNA sequencing,简称 NGS)数据,可以识别基因变异,并进一步转化为图像辨识,从而在重组基因组序列上,比以往的方法具有更高的准确性。 DNAnexus 指出,他们公司少数的客户可以透过他们的平台去使用 DeepVariant 的数据分析。然而,DNAnexus 也承诺消费者,在未来几个月内,他们将可以更广泛使用此平台。

DNAnexus 首席执行官 Richard Daly 表示,深度学习的数据分析工具,将能够大大帮助他们公司对疾病的生物标记(biomarkers)有更进一步的探讨与了解。此外,通过 DNAnexus 的主结构,也能支持这些复杂的科技与技术。

DNAnexus 科学部门副经理 Andrew Carroll 和生物信息学家 Naina Thangaraj 指出,过去十年间,科学家在面对单核苷酸多型性(Single-nucleotide polymorphism,简称 SNP)和 NGS 数据基因位点插入或剔除识别(indel calling)等问题时,持续不断提出改良解决的办法。然而,通过这项思想稠密的深层学习网络系统的运用,在短短几年间,已经使得 DeepVariant 的准确率高于传统方法。

  • 发表于:
  • 原文链接http://kuaibao.qq.com/s/20171215B02FYA00?refer=cp_1026
  • 腾讯「云+社区」是腾讯内容开放平台帐号(企鹅号)传播渠道之一,根据《腾讯内容开放平台服务协议》转载发布内容。
  • 如有侵权,请联系 yunjia_community@tencent.com 删除。

同媒体快讯

扫码关注云+社区

领取腾讯云代金券