Dr社区：非编码RNA介绍

Dr高端社群分享主题二：

【非编码RNA】介绍

注：文章最后扫码报名

生物信息学（bioinformatics）定义：是在大分子方面的概念型的生物学，并且使用了信息学的技术，这包括了从应用数学、计算机科学以及统计学等学科衍生而来各种方法，并以此在大尺度上来理解和组织与生物大分子相关的信息。

非编码RNA（Non-coding RNA）是指不编码蛋白质的RNA。它包括两种（1）序列短的RNA：snRNA、miRNA、piRNA、siRNA等；（2）序列长的RNA：lncRNA、circRNA等。我们生物信息上经常用来做分析的是其中的3种：miRNA、lncRNA和circRNA。

非编码RNA虽然不编码蛋白，但是它们能够直接或者间接的调控基因，从而影响基因功能，是非常重要的小分子。本主题针对非编码RNA进行深入的讨论和学习。不仅仅要分别讲解每种非编码RNA的特点、功能等，还会把它们做为一个整体进行分析，目前比较火热的ceRNA分析（竞争性内源RNA）就是基于编码+非编码RNA的整体思路进行的。

那么非编码RNA的重要性有多高呢？我们举个栗子！

根据统计的2003年到2017年发表文章数量，从数据看lncRNA的研究呈现逐年上升的趋势，2016年比15年将近翻了一倍！预计2018年，lncRNA研究会席卷各类基金申请及杂志期刊！

厉害了！！

生物信息学魅力

生物信息学魅力：

帮助预测疾病相关的潜在基因，以及该基因潜在的作用靶点、上游调控转录因子等，从而指导实验方向、缩小试验范围、简化试验流程。

为基金申请提供支持，通过强大的信息数据的收集整理，减少投入增强研究目的性；且通过整合技术优势，指导提高临床诊断水平。

丰富的免费的数据资源和生物软件工具。

主题大纲：

第一节：miRNA专题

miRNA简介

miRNA测序

miRNA相关分析

miRNA分析工具/数据库

第二节：lncRNA专题

lncRNA简介

lncRNA测序

lncRNA相关分析

lncRNA分析工具/数据库

第三节：circRNA专题

circRNA简介

circRNA测序

circRNA相关分析

circRNA分析工具/数据库

第四节：ceRNA假说

ceRNA简介

ceRNA网络分析

ceRNA分析案例

注：ceRNA指竞争性内源RNA。

通过该主题的学习，可以学会：

各种非编码RNA的检索数据库

miRNA靶基因预测分析

miRNA靶基因结合位点分析

各种非编码RNA的在线分析工具

miRNA/lncRNA/circRNA的功能分析。

miRNA调控网络构建

ceRNA网络关系获得及网络图构建。

通过4节课的学习，我们可以掌握关于非编码RNA（miRNA/lncRNA/circRNA）的相关数据库、分析工具以及分析思路。打开一扇关于非编码RNA转录调控分析的大门。

示例图 ceRNA分析。彩色节点代表miRNA；黑色节点代表lncRNA；灰色节点代表mRNA。

示例图 miRNA-target调控网络图

示例图 miRNA靶基因结合位点

搞|事|情

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