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宝德HPC+AI方案,助力先声药业加快药物研发脚步

当代科学的发展和重大科学技术成就的取得

不仅越来越依赖于不同学科的交叉与融合

更离不开IT硬件提供的高性能计算能力

AI深度学习和药物设计信息计算

宝德助力先声药业创新中心

构建HPC+AI高性能计算集群

为企业药物研究和创新带来关键动力

    在现代科研活动中,计算已经成为理论、实验鼎足而立的第三个支柱。能够帮助科研工作者更加深入、更加精细和更大规模的对研究对象进行分析和计算模拟,成为加速获取研究成果不可替代的手段。

全球新冠疫情的影响,再度加强了人们对药物开发的重视程度。在这种大趋势下,先声药业创新中心希望通过硬件设备升级,来提升药物研究效率。宝德为其注入关键动力,助力构建异构高性能计算服务平台,为关键领域的精锐研发力量提供研究的战略性计算服务能力,并提升研究创新能力和整体效率。

关于先声药业创新中心

     先声药业创新中心是先声药业集团重要的创新药研发基地。经过多年发展,现有创新药研发团队200多人,拥有超2000平米的实验室,聚焦肿瘤、自身免疫、中枢神经系统疾病领域的创新生物药、化学药的研发。

对每一个科研工作者来说,计算能力从来没有像今天这般重要

    在与先声药业创新中心的合作中,宝德提供了HPC高性能计算与AI平台方案,其强大的计算能力,能够帮助药物研究工作者更快地得出结果,带来更高的研发效率。

    例如,HPC高性能计算与AI平台全面支持基于深度学习的分子图编码和基于深度学习的药物开发。研发人员通过卷积神经网络或递归神经网构建多任务的分子预测模型,利用交叉验证来调参和验证,用外部数据来测试和评估模型,以此从预测模型中挖掘关键的信息。

    通过卷积神经网络或递归神经网络学习大量的方剂配伍信息,然后利用主药生成通过语义的自动关联分析得到的辅药,从而产生新的方剂。HPC高性能计算与AI平台提供了高效并行的计算资源,大大加快了模型的训练,从而在有效时间内完成最终任务。

    同时,宝德的HPC高性能计算与AI平台也在AI深度学习方面,为新药研发提供了高效计算支持。比如,平台支持基于化学片段的从头计算药物设计,对于疾病的治疗和生物学功能的理解起到了重要的推动作用。传统的药物筛选过程耗时长、费用高,造成整个药物设计与发现过程效率低下。为了加速药物设计与发现过程,科研人员利用该平台进行分子从头设计的方法逐渐获得发展,并取得了良好的效果。

而帮助先声药业创新中心加快药物研发步伐的,正是建立在这样一套硬件基础架构之上

   硬件上,HPC高性能计算与AI计算平台的计算节点采用宝德通用双路服务器PR2710P、GPU节点采用宝德AI加速服务器PR4910P、存储节点采用宝德存储服务器PR4036P。其中计算节点超144个,GPU节点超20个,1个存储节点,整体性能超过预期。

宝德通用双路服务器PR2710P

宝德AI加速服务器PR4910P

宝德存储服务器PR4036P

    计算网络方面,采用了InfiniBand方案,做到了点到点全线速、无阻塞,兼容集群软件管理,提供了对每个集群节点的管理需求型访问。

    截至目前,宝德HPC高性能计算与AI平台已经正式上线运行,目前系统运行稳定,为先声药业的深度学习和药物研发提供了坚实的计算基础。

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  • 原文链接https://kuaibao.qq.com/s/20200629A0CLPS00?refer=cp_1026
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