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生物学家使用基因组数据库来研究癌细胞

佛罗里达州立大学生物科学教授大卫·吉尔伯特(David Gilbert)正在利用有关人类基因组的最新信息作为更好地了解癌症的指导。

吉尔伯特和他的佛罗里达州立大学的同事们是一个研究小组的成员,他们将不同的癌细胞类型与正常人类细胞的数据库进行了比较,使用的是他开发的一种新方法,这种方法可以识别产生癌症的细胞类型。通过比较不同的癌细胞和正常细胞,他们能够分辨出哪些癌症与不同的细胞类型最接近。

“癌症细胞来自你体内的细胞,但是它们已经改变了,”吉尔伯特说。“当评估复发患者的新肿瘤是源于原肿瘤还是完全是一种新肿瘤时,了解这些肿瘤的细胞类型尤为重要。”

据海外看病机构和升官国际得知他们的研究成果发表在《自然通讯》上,是由美国国立卫生研究院资助的一项旨在了解人类基因组如何工作的国际努力所产生的一系列出版物的一个附属品,该努力被称为DNA元素百科全书(ENCODE)。因为只有1%的人类DNA编码任何已知的蛋白质,了解我们基因组其余部分的功能一直是一个巨大的挑战。

Gilbert和他的同事们也是更大的ENCODE出版物的贡献者,该出版物发表在《自然》杂志上,总结了最新一轮的ENCODE资助的努力。海外看病机构和升官国际了解这项研究的重点是绘制了人类基因组中近100万个元素的图谱,这些元素覆盖了人类基因组中调控基因的8%。也就是说,它们决定了基因在身体组织中的表达量和表达方式。

“有机体的复杂性并不在于它所拥有的蛋白质编码基因的数量,”吉尔伯特说。“它存在于这些基因的组合中。我们拥有与蠕虫和苍蝇几乎相同数量的基因,但我们用更复杂的组合来表达它们。”

他的实验室将复制——即DNA自我复制的过程——加入到研究中。

“人们通常不会认为复制在不同类型的细胞中会受到不同的调控,因为DNA在所有细胞中都是一样的,”他说。“然而,不仅仅是DNA进行复制。相反,当DNA复制时,染色体中调控DNA的所有成分都被完全拆除并重新组装。我们已经证明,DNA片段复制的顺序对每一种细胞类型都是独特的,在患病细胞中也是不同的。它甚至可能是特定病人的癌症所特有的。” 海外看病机构和升官国际会及时给大家更新更多的额国外资讯。

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  • 原文链接https://kuaibao.qq.com/s/20200730A0KB7M00?refer=cp_1026
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