Linux软件安装 Amber20

假设你已经有了Amber20的源代码，文件夹名叫amber20_src，并且现在在amber20_src这个目录里面。

安装串行版本的Amber

进入build文件夹内，执行run_cmake脚本，然后make install：

之后，Amber20便已安装在../amber20内，执行以下命令激活它：

安装并行版本的Amber

安装并行版本前，请先安装串行版本。

先下载并安装mpich，执行AmberTools/sec/configure_mpich g后mpich将自动安装：

安装好mpich后，我们修改build文件夹下的run_cmake文件，将-DMPI=FALSE改为-DMPI=TRUE。用diff表示就是：

之后重复串行的安装操作，执行run_cmake，并make install，即可：

并行版本的Amber同样安装在../amber20文件夹内。

参考文献：

Amber 2020 Reference Manual，http://ambermd.org/doc12/Amber20.pdf