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微生物多样性APP全新升级

百迈客微生物多样性APP分析全面升级,引入了DADA2方法可针对二代三代数据进行ASVs分析;提供了不同的参考数据库进行物种注释分析;此外还使用了QIIME2平台中多种物种注释方法,包括基于比对方法、基于朴素贝叶斯分类器方法和二者的结合(不能精确比对数据库的特征序列再使用分类器进行分类)。现在赶紧来看看应该如何操作吧!

第一步:登录百迈客云平台后点击分析==>微生物多样性分析平台==>运行软件,之后创建项目名称并选择数据类型;

第二步:导入数据、确认引物、修改样品名称;

第三步:选择是否进行样品合并(这里是指将样品数据合并)并选择后续分析的样品;

第四步:选择分子标记类型;

第五步:选择分析参数,包括参考数据库选择(silva、ncbi、greengene、unite和Fungene)、聚类方法选择(相似性聚类和dada2去噪)、分类方法选择(基于比对、基于朴素贝叶斯分类器和二者的结合)和过滤参数选择;

第六步:根据实验因素,填写环境因子信息

第七步:根据实验设计设置样品分组信息,最后确认参数无误后点击提交即可进行微生物多样性分析;

怎么样,是不是很简单呢?如果您手中有数据需要分析或者想尝试不同分析方法和数据库,赶紧来试试吧!

文:LHZ

排版:市场部

百迈客现提供“测序分析+分子试剂+实验仪器”一站式解决方案,与分子实验相关试剂盒如提取试剂盒、反转试剂盒、qPCR试剂盒、PCR Mix、无缝克隆、建库试剂盒等试剂盒均有现货,试剂促销活动详情可咨询驻地销售专员!

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  • 原文链接https://kuaibao.qq.com/s/20201110A0BIRW00?refer=cp_1026
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