韦恩图在组学研究中,常用来展示不同样本或集合间共有或者特有的元素信息,我们会用不同的样式效果展示不同的分组数:
(OmicShare-维恩图/动态丰度维恩图工具)
分组数量过多时,更建议使用upset图进行直观展示:
(OmicShare-UpSet维恩图/动态丰度Upset图工具)
如果不常用代码的朋友,可以直接通过OmicShare云工具平台(https://www.omicshare.com/tools/)一键绘制!
那Upset图在R语言中要如何绘制呢?今天我们就来学习一番,使用到UpSetR包!
上方柱形图展示了集合特有或共有的元素数量,左方条形图展示各个集合中的元素总数,中心的交集矩阵中,单个颜色节点表示统计的特有元素信息,连线节点则表示统计的共有元素信息。
绘制起来还是比较easy的,更多说明可参考作者说明。
好啦,今天的分享就到这里!
参考资料
https://github.com/hms-dbmi/UpSetR
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