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1.差异分析筛选基因:MAOA(按照FC排序取top10)(NCBI-GeneID :4128)
计数结果的差异的影响因素:落在参考区域上下限的read是否需要被统计,按照什么样的标准进行统计。
NCBI:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/projects/genome/guide/human/index.shtml
FastQC主页:http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/
(1) 磁珠富集真核生物mRNA(此步骤对RNA的完整性要求比较高,一般RIN值要大于8);
Linux系统环境 • 查看CPU信息:lscpu • 查看内存信息:free -h • 查看硬盘信息:df -h • 查看文件大小:du -h -d 1 • ...
在长长的列表里,往下翻(或者用ctrl+f搜索关键词miniconda3-latest)找到:Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh...
是对字符串操作的一种逻辑公式,就是用事先定义好的一些特定字符、及这些特定字符的组合,组成一个“规则字符串”,这个“规则字符串”用来表达对字符串的一种过滤逻辑。
Linux上的文本编辑器vim 图片 命令模式 • 用vim FILENAME进入之后的默认模式 • 可以“上下左右”移动光标 • 可以剪切字符或整行、也可复制...
linux系统简介命令格式:命令+参数+文件修改命令行配色echo 'export PS1="\[\033]2;\h:\u \w\007\033[33;1m\...
差异分析可视化 rm(list = ls()) load(file = "step1output.Rdata") load(file = "step4outp...
geoChina的用法 #数据下载 rm(list = ls()) library(GEOquery) #先去网页确定是否是表达芯片数据,不是的话不能用本流程。...
检查矩阵是否正常,如果是空的就会报错,空的和有负值的、有异常值的矩阵需要处理原始数据。0~20之间就是一个已经取过log的矩阵
专题一:玩转字符串1.检测字符串长度x <- "The birch canoe slid on the smooth planks."xstr_length(x...
图片 图片 常用可视化R包 作图 base ggplot2(特殊语法:列名不带引号,行末写加号) 图片 颜色:color 大小:size 形状:shape 图...
文件读取和导出 图片 read.csv("ex3.csv.csv") csv可以用excel、记事本、sublime(适用大文件)、R语言打开 纯文本文件的后缀...
形式参数与实际参数 图片 jimmy <- function(a,b,m = 2){ (a+b)^m } #function就是用来写函数的函数 jimmy...
each和times的区别是times输出的是abcdabcdabcd,each输出的是aaabbbcccddd
paste0(rep(“x",3),1:3)和paste0(”x”,1:3)是一样的
以下图片与知识点均来自生信技能树,本文章仅供本人笔记使用 感谢老师们地耐心讲解 如何在R studio中新建项目R project 图片 如何设置字号 图片 如...
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