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在第一讲我们详细介绍了GEO数据库的基础知识及规律，也了解了如何利用官方R包GEOquery来探索GEO数据库，当然，我的生信菜鸟团博客里面也从很多其它角度解析...
通过前面的讲解，我们顺利的了解了GEO数据库以及如何下载其数据，得到我们想要的表达矩阵，也学会了两个常用的套路分析得到的表达矩阵，就是GSEA分析和差异分析。 ...
通过前面的讲解，我们顺利的了解了GEO数据库以及如何下载其数据，得到我们想要的表达矩阵，但，这只是分析的开始，最经典的分析就是GSEA了，看看基因全局表达量的变...
通过前面的讲解，我们顺利的了解了GEO数据库以及如何下载其数据，得到我们想要的表达矩阵，也成功的使用了GSEA这个分析套路。 历史目录： 解读GEO数据存放规律...
这篇跟之前的一篇博文Bioconductor的DNA甲基化芯片分析流程一样，主要简单的记录下如何基于bioconductor的R包对蛋白组质谱数据进行分析。在看...
随着单细胞以及单核测序（single-cell and single-nucleus RNA-sequencing）的快速发展以及逐渐普及，越来越多的单细胞测序...
我最早接触的高通量数据就是RNA-seq，后来接触的也基本是高通量测序结果而不是芯片数据，因此我从来没有分析过一次芯片数据，而最近有一个学员在看生信技能树在腾讯...
本文属于转录组入门系列（RAN-seq基础入门传送门 http://www.biotrainee.com/thread-1750-1-1.html ）第2部分内...
---title: "GEO表达芯片数据分析"output: html_documentdate: "2023-03-20"---关于该流程代码的说明：（1）本...
第一讲：文献选择与解读 前阵子逛BioStar论坛的时候看到了一个关于miRNA分析的问题，提问者从NCBI的SRA中下载文献提供的原始数据，然后处理的时候出现...
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TA 很懒，什么都没有留下╮（╯＿╰）╭
