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https://github.com/emilmalta/30daychartchallenge/blob/master/script/22_animation...
我们之前也有过一个专辑:《cytoscape十大插件》,详见:cytoscape十大插件之九 - 转录调控王者 iRegulon,而且在b站有配套视频操作演示,...
其实转录组走到现在我总觉得少了点什么东西,后来才想起来是cytospace寻找hub基因
连续两次求贤令:曾经我给你带来了十万用户,但现在祝你倒闭,以及 生信技能树知识整理实习生招募,让我走大运结识了几位优秀小伙伴!大家开始根据我的ngs组学视频进行...
昨天我们介绍了利用STRING数据库来进行蛋白相互作用预测(STRING:蛋白相互作用数据库的使用),但是我们只是获得了相互作用网络分析的数据以及可以使用的相关...
关于探究的蛋白质相互作用的数据库,之前介绍过STRING就是这样的数据库,为什么很多生信的文章都是使用STRING来探讨基因之间的相互作用关系,主要原因还是ST...
现在在进行医学科学研究的时候,如果要研究一个方向,我们经常会去查一下网上都有哪些数据库可以让我们使用,通过数据库的预测来进行确定我们自己的方向。但是要怎么找这些...
昨天我们介绍了一些网络分析当中用到的一些基础的知识(相互作用网络分析基础)。对于基因组数据分析而言的话,我们能用到网络分析的就是蛋白相互作用分析(protein...
以下部分是基于《Fundamentals of Data Visualization》学习笔记,最近可能会不定期连载哦!要是有兴趣还等不及更新的话,可以直接看原...
使用R读取txt文件直接使用read.table()方法进行读取即可,不需要加载额外的包。
topGO是一个专门用于做GO富集分析的R包,它默认从GO.db中读取GO的分类和结构信息,结合富集分析的结果,它可以画出如下所示的GO有向无环图
上一次推文已经给大家介绍了常见的富集分析类型以及如何使用全能的R包clusterprofiler实现,详情请见:富集分析常见类型
enrichplot实现了多种可视化方法来解释富集结果。支持从DOSE (Yu et al. 2015)、clusterProfiler (Yu et al. ...
之前的推文介绍了画柱形图展示富集分析的结果R语言ggplot2做柱形图展示富集分析的结果,今天的推文介绍一下画气泡图展示富集分析结果的代码。气泡图就是散点图的一...
我们利用Excel整理表格中的数据,但是有时候表格中的一些内容是重复的需要进行筛选,因为这样可以让那个我们表格内容更加清晰,那么Excel怎么筛选重复项呢?你可...
统计学中有两大分支——描述性统计学(description stats)和推断性统计学(inference stats)。 推断性统计学中,很重要的一点就是...
我们经常在科研文章中看到功能富集分析,包括GO和KEGG富集分析。前面我们也给大家分享过一些GO和KEGG富集分析相关的一些文章
作为一个科研人,每个人都会有自己的研究方向。在进行自己研究的同时,也要实时追踪根据自己研究方向有关的文献。所以今天就来给大家介绍几个用来追踪自己研究方向的方法。
近些年来,过去被视作冗余垃圾的Noncoding RNAs被发现在基因表达调控中发挥了重要作用
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TA 很懒,什么都没有留下╮(╯_╰)╭