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在研究基因序列层面变化的时候,对基因组序列有一个全面的认知及学会怎么对序列基本操作十分重要。
GFF 文件 GFF全称为general feature format,这种格式主要是用来注释基因组。 从 Ensembl 导出的GFF文件示例: X E...
饼图把一个圆分成多个部分,这些部分的弧长(以及面积)代表一个整体的比例。月亮图也是如此,它把一个圆分成多个部分,这些部分的面积代表整个圆的比例,但在月亮图中,这...
冗余分析(redundancy analysis, RDA)自己之前也听过,好像是生态学研究中用的比较多,主要是用来探索环境和一些样本指标之间的关系。最近自己在...
这一步可以拿到gene_id还有gene_name ,FPKM的表达量,cov对用的应该是reads count吧。
https://www.nature.com/articles/s41467-022-34206-8
之前有人在公众号留言问过用R语言如何实现t-SNE降维,今天的推文介绍一下R语言实现的代码,主要内容参考自链接 https://datavizpyr.com/h...
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