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今天卡卡在处理RNA-seq的数据,整理出来一份上游的处理流程,分享给大家。从环境搭建到最终的表达量定量,一步步带你掌握RNA-seq数据分析的核心技能。
分享RNA-seq数据处理流程
今天卡卡给大家介绍一个单细胞上游处理最常用到的软件包——CellRanger。跟着卡卡一起来看一下吧
Linux上游分享,分享使用分析代码
生物系统中各种分子和物理作用复杂,各种细胞亚型依赖于环境的方式执行不同的功能。肿瘤的发生是高度异质性的,而目前的研究对异质性的理解主要局限于癌细胞,而忽略了肿瘤...
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单细胞RNA测序技术的快速发展为我们研究复杂生物系统提供了前所未有的机会。在海量的单细胞数据中,识别和可视化特征基因(marker genes)是理解细胞类型和...
随着生物信息学技术和AI技术的发展,python以更快的运行速度和更少的内存占用率越来越受到欢迎。
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之前的推文中,卡卡已经带大家学习了Pan-cancer T cell atlas links a cellular stress response state ...
卡卡继续带着大家在顶刊挖图,今天学习的仍然是这篇泛癌T细胞的文章。先上图:对CD8T细胞进行功能评分并且绘制热图
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