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今天卡卡给大家介绍一个单细胞上游处理最常用到的软件包——CellRanger。跟着卡卡一起来看一下吧
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生物系统中各种分子和物理作用复杂,各种细胞亚型依赖于环境的方式执行不同的功能。肿瘤的发生是高度异质性的,而目前的研究对异质性的理解主要局限于癌细胞,而忽略了肿瘤...
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单细胞RNA测序技术的快速发展为我们研究复杂生物系统提供了前所未有的机会。在海量的单细胞数据中,识别和可视化特征基因(marker genes)是理解细胞类型和...
随着生物信息学技术和AI技术的发展,python以更快的运行速度和更少的内存占用率越来越受到欢迎。
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在Linux环境中,RStudio-Server与Windows版本不同,一个用户只能同时开启一个RStudio窗口。若需要同时使用多个RStudio工作环境,...
之前的推文中,卡卡已经带大家学习了Pan-cancer T cell atlas links a cellular stress response state ...
卡卡继续带着大家在顶刊挖图,今天学习的仍然是这篇泛癌T细胞的文章。先上图:对CD8T细胞进行功能评分并且绘制热图
复现之后卡卡总是觉得效果不尽人意!翻来覆去,卡卡找到原到了作者原文章的代码,再次进行复现,这次可以说是百分之百的还原度了!😍
R语言的corrplot包提供了一种可视化相关矩阵的探索性工具,支持自动变量重排序以帮助发现变量间的隐藏模式。
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