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基因组从头测序(de novo)相关软件

回顾一下: 在使用aspera从SRA数据库得到二代测序的原始数据之后,我们使用ncbi的sratoolkit做过数据格式转化,然后使用fastqc做了质量分析...

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Python
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shell脚本实现基因重测序和变异位点检测(附源代码)源代码在文末

基因组重测序和变异的这一节,之前有花时间学习过,所以整个过程,心中也大致有一些脉络,下面就当是做一个回顾。 下面引用一下,谈老师ppt里面的一张图:

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Shell
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VMware的linux虚拟机磁盘扩容

因为之前遇到过这个问题,论坛里也有几个解决办法,不过感觉还是有点麻烦,所以自己百度了好久才找到比较简单易懂的方法。

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Linux
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VMware的linux虚拟机磁盘扩容

因为之前遇到过这个问题,论坛里也有几个解决办法,不过感觉还是有点麻烦,所以自己百度了好久才找到比较简单易懂的方法。

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Linux
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Linux习题作业解答(非标准答案)

(这里的主目录视为新建目录或者home目录都可以,问题不大,操作会就行,我这里统一视为主目录为返回home目录) 1 创建目录,并建立空白文档,回到主目录下,去...

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Linux
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linux环境下R语言的安装运行以及程序包的下载

R是一种多功能型统计绘图软件,可以方便的编写函数、建立模型,具有良好的扩展性。目前在R网站上约有2400个程序包,涵盖了基础统计学、社会学、经济学、生态学、空间...

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Linux
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对bootstrap框架的一些测试(1)

bootstrap的栅格系统,默认将整个屏幕放在一个“container”容器中,然后以row为子元素,将‘col‘作为直接子元素,把整个屏幕分成12份,然后对...

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Bootstrap
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使用c#连接sqlserver

连接数据库是一个常见的操作,现在主流的关系数据库主要是sqlserver,mysql,Oracle,今天来聊一聊使用c#如何连接sqlserver。

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数据库
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用shell脚本实现转录组测序中 解压-比对-计算基因表达量 一体化

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Shell
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第二次RNA-seq实战总结(1)软件的准备

在经历了第一次做·RNA-seq的摸爬滚打之后,我大概对RNA-seq的流程和要使用的软件有了一些了解,并知道了它们的用法,于是便做了第二次的RNA-seq,然...

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Anaconda
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第二次RNA-seq实战总结(2)-数据下载并进行数据处理

原始数据来源于这篇文章https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE50177 这篇文章的数据适中...

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Java
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第二次RNA-seq实战总结(3)-用DESeq2进行基因表达差异分析

DESeq2是一个用于分析基因表达差异的R包,具体操作姚在R语言中运行 1.R语言安装DESeq2

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Java
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一些生信工具的总结

2.ncbi中SRA的ftp下载链接为: ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/sra/, SRA数据库的格式为:

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Java
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(python小白必看!)python爬虫详细讲解:静态单网页的内容爬取 爬取对象:百度贴吧湖北大学吧

之前发了一篇关于文件处理小实验的文章,不知道大家有没有看呢?那篇文章真的很关键,之前我本以为没有爬取成功的原因是因为我的文件处理部分出现的问题,后来经过两个小测...

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Python
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python爬虫:利用函数封装爬取多个网页,并将爬取的信息保存在excel中(涉及编码和pandas库的使用)

在之前的文章中,我们已经爬取了单网页的湖北大学贴吧的信息。 仔细想一想,单网页也才只有50条信息,如果你想找到女神在哪些时间段发了哪些帖子,这么点信息是远远不够...

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Python
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python爬虫:爬取58同城武汉地区商品房信息(最后碰到了58同城的反爬机制,吓得我不敢说话···)

今天外面天气有些古怪,女朋友明天又要考试,整整一天都在图书馆背书。遇到这种情况,像我这么懒的人,肯定就只有在宿舍玩游戏了。 可是,,,玩游戏真的很无聊耶,我都玩...

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Python爬虫
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python:处理字符串的另一大神器——正则表达式,利用正则提取豆瓣电影排行榜信息

在之前的文章中,我们已经学会了使用bs4库中的BeautifulSoup,用于获取网页源代码中的标签。 今天来一起学习一下正则表达式。

HUBU生信
Python
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python爬虫:爬取笔趣小说网站首页所有的小说内容,并保存到本地(单线程爬取,似乎有点慢)

这几天在进行新的内容学习,并且在尝试使用据说是全宇宙唯一一款专门开发python的ide工具,叫做pycharm。

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