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仅通过简单的文字提示(填词),你便能迅速创作出一首包含背景音乐和填词的两分钟完整曲目。
很久很久之前就对Rosetta有所耳闻,有一篇文章叫做denovo protein design,说的就是用rosetta来设计蛋白质。
最近在帮实验室的学姐分析一些蛋白质序列,然后就接触到了DSSP这个算法。于是写一篇小笔记,仅此来记录一下本次的使用记录。
好了,今天的分享暂时到这里,gpt4的食用指南还有很多类别,下篇文章我们继续探讨如何让gpt4充当不同的角色。有什么问题欢迎大家一起和Tom交流和讨论。
命名实体识别(NER)是自然语言处理中的一项关键任务,旨在从文本中识别并提取出具有特定意义的实体,如人名、地名、组织机构名等。通过NER,计算机可以更好地理解文...
huggingface的官网,一般都是打不开的状态。首先,我们来介绍一个huggingface的镜像:
正如我们看到的,效果很差,一个重要的原因就是有标签的节点数量过少,训练的时候会有一些过拟合
一种名为 GraphDTA 的新模型,它将药物表示为图,并使用图神经网络来预测药物-靶点亲和力。我们的研究表明,图神经网络不仅能比非深度学习模型更好地预测药物与...
首先第一个很重要的函数,通过pdb文件加载蛋白质结构,我们接下来的操作都将基于此函数的返回进行操作:
所以 sid cid 和aid其实都是一些化合物的id,我们可以通过请求这个id来获得与其对应的属性:
也是torch_geometric自带的一个数据集,专门用于图神经网络入门的开胃小菜。
今天使用cloba版本的alpahfold预测了21个蛋白质序列。用过colab版本的alphafold的你应该知道,alphafold运行结束之后会自动下载一...
这张图则是介绍了顶点嵌入的目标,就是使嵌入前和嵌入后的两个的相似度保持尽可能的相等。
今天使用图神经网络和一个很新的库StellarGraph,然后基于TensorFlow搭建了一个分类模型
今天我们使用的是声呐的数据集,本数据集使用声呐探测了金属和岩石,记录了它返回的波长。
最后一列是第九列分别是0,1这里笔者应该能猜到这是患病与否的标致,0就是没有糖尿病,1就是有糖尿病。
那么就有我们的方程:Y=x2+2x+1,然后使用np中的多项式函数可以写成这个样子:
最近在看ESMfold和embedding的知识,然后就来简单写一个简单易懂的蛋白质embedding的demo
Let's first look at how you would do unconditional design of a protein of length...
后半部分需要用到selenium但是目前电脑的chrome版本过高,就先不继续后半部分的代码编写
暂未填写公司和职称
暂未填写个人网址