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在孟德尔随机化研究（Mendelian randomization，MR）中，最常见的是单样本和双样本孟德尔随机化设计。这两种类型的孟德尔随机化研究通常只选取一...
在目前的大量孟德尔随机化研究中，很多研究者只是单纯考虑单核苷酸多态性（SNP）的统计学显著性而忽视了一个非常重要的点------SNP的生物学相关性，这可能是因...
前两期的内容带大家学习了如何在windows系统上安装Linux子系统以及LDSC的安装，今天我将带大家正式开展LDSC分析并解读相关结果。
在上一期的内容中，我带大家完成了Linux子系统的安装，今天我们就要开始在Linux子系统上安装LDSC了，这也是一个很大的坑！！！
LDSC （LD Score Regression）是基于LD评分的回归分析，主要用于计算表型的可遗传度（heritability）和表型间的遗传关联度（gen...
韦恩图（Venn diagram）是一种能直观展示不同数据集之间的集合关系的图，常见的集合运算主要包括：交集（intersection），并集（union）和补...
在孟德尔随机化研究中，弱工具变量偏倚（weak instrument bias）是需要我们认真对待的一个问题，它通常是因为样本量较小导致的。在往期推送中，米老鼠...
在往期内容中，米老鼠和大家简单介绍过做孟德尔随机化研究使用到的数据库，主要是OpenGWAS， GWAS Catalog 和Phenoscanner这三个。其中...
在孟德尔随机化研究中，我们常常会碰到SNP没有rsid的情况，这个时候需要我们把rsid添加上，如果SNP的个数不是很多的话，我们可以使用variants_ch...
在进行孟德尔随机化（Mendelian randomization, MR）研究时，我们最常使用的一个R包就是“TwoSampleMR”，这个包是由“MRCIE...
水平多效性（horizontal pleiotropy）一直是孟德尔随机化研究（Mendelian randomization，MR）所需要面对的大问题。关于水...
人体每天大约产生2000亿个红细胞，每秒大约需要2 × 3 E15个铁原子来维持红细胞的生成。因此，缺铁是贫血的常见原因。此外，铁代谢紊乱与癌症等疾病发展有关。...
近些年，随着大家生活水平的不断提高，越来越多的人开始更加关心自己的健康问题；而体检，就是一个及时筛查各种健康问题的好方法。但是随着各种体检项目和各种癌症筛查项目...
KEGG数据库是我们经常用的一个生物医学数据库，虽然KEGG网站用起来很方便，但是如果想批量获取数据并整理成结果的话，使用R语言处理无疑是一个比较好的选择。
无论是在进行全基因组关联研究（GWAS）还是孟德尔随机化研究（MR）中，我们都需要考虑SNP间的连锁不平衡（LD）信息，这里小陈给大家简单介绍一下用于LD分析...
在“MendelianRandomization”包的前四讲内容中，米老鼠和大家介绍的都是单变量MR研究，也即一个暴露对应一个结局的研究。不过，我们在这...
在前三讲的内容中，我和大家逐一介绍了IVW，median-based，MR-Egger和maximum likelihood这四种计算方法，并结合“Mend...
在前两期推送中，我和大家分别介绍了“MendelianRandomization”的IVW和median-based方法，并详细介绍了这两种方法的参数以及使用建...
在上一期推送中，我和大家详解介绍了“MendelianRandomization”包的输入文件以及其IVW方法，在这一期的推送中，我会和大家简单介绍一下这个包的...
之前和大家详细介绍过“TwoSampleMR”包和“MRPRESSO”这两个常用的进行孟德尔随机化分析的R包，但是很多朋友实际上会用到“MendelianRan...
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