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如bwa 等软件，我们可以分配多线程以提高任务的执行速度的。同样，我们可以把线程的信息配置在规则中：
这个snakemake workflow 主要包括：mapping, sort >> index >> call variants
对于工作流来说，Directed acyclic graph，有向非循环图是一个非常不错的展示的策略。
我自己一直在寻求可以将不同的工作流串接的方式。之前尝试了nextflow，但发现语法让我头疼。无奈发现了基于python 框架的snakemake，如释重负，立...
bed格式文件至少包括前3列，分别是：染色体的名字、染色体上的起始位置、染色体上的终止位置。这一步无论用写字板、excel、R等进行处理都可以，文件的后缀名也不...
解决方式也简单，加上代码：options( 'download.file.method.GEOquery' = 'libcurl' ) 即可！
之前我们在介绍很多转录调控相关的数据库的时候，都会提到这些数据库包含了ENCODE数据库。那么ENCODE数据库是什么样的数据库呢？
featuresCounts软件用于统计基因/转录本上mapping的reads数，也就是用于raw count定量。该软件不仅支持基因/转录本的定量，也支持e...
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TA 很懒，什么都没有留下╮（╯＿╰）╭
