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近年来,单细胞转录组测序技术的飞速进展揭示了真核生物细胞类型和状态的巨大转录异质性,对生物学研究带来深远影响。目前虽然已有若干将单细胞转录组测序应用到细菌样本上...
在上一期推文单细胞数据标准化及高变基因鉴定里面有整理单细胞下游分析基本流程及使用到的函数
文章标题:《Single-Cell Genomics Reveals a Novel Cell State During Smooth Muscle Cell ...
Single-cell transcriptomics identifies Mcl-1 as atarget for senolytic therapy in...
单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)的应用使得研究人员能够在更细致的层面上理解这些细胞亚群的异质性和功能。这些信息对于研究胰腺疾病的发病机制、开发新的治疗...
过去的一周,我的心绪总在跌宕着。每一天都有新的事情发生,使我不能静静地在键盘上回复你的留言,想说的话题好像很多,多到一定程度,又不知从何说起。
文章标题:《Cell-specific expression of lung disease risk-related genes in the human s...
黑色素瘤的分期通常基于肿瘤的厚度(Breslow 厚度)、是否有溃疡、淋巴结受累情况以及是否有远处转移。分期系统如 AJCC(美国癌症联合委员会)TNM 分期系...
咱们的#单细胞常见图表系列推文,首先会按照单细胞下游分析基本流程整理里面的常见的图表,以及分析的过程
文章标题:《Stem-like CD4+ T cells in perivascular tertiary lymphoid structures sustai...
交流群的小伙伴表示它这个文章的数据集里面的样品数量和细胞数量的关系很奇怪,数据集是:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query...
文献标题:Integrating microarray-based spatial transcriptomics and single-cell RNA-se...
首先是在Cell上发表了题为“Neutrophil profiling illuminates anti-tumor antigen-presenting po...
其实他们挖掘的是他们课题组自己的2021的文章的单细胞转录组数据:ischemic mouse brains at 5 and 14 days after tM...
但并不是所有人都是研究肿瘤的,也有一些其它领域的单细胞亚群值得整理和分享,比如软骨相关的单细胞亚群。目前主要是在腰椎间盘和骨关节相关的疾病研究看到它。而且腰椎间...
数据集是:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE220243
该论文探讨了在早期膀胱癌(BCa)中,癌相关成纤维细胞(CAFs)的异质性及其功能。通过使用scRNA和空间转录组学技术,发现了一种之前未知的表达PDGFRa+...
文章标题:《Single-cell and spatial transcriptomics of the infarcted heart define the ...
在ncount_RNA 和nFeature_RNA辅助过滤中,使用小提琴图对所有细胞中检测到的分子总数(ncount_RNA )以及基因数量(nFeature_...
上篇推文中对ncount_RNA 和nFeature_RNA进行了可视化,然后基于可视化结果进行了阈值的判断,并且也给大家分享了在实际分析中的应用
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