学习小组Day6——学习R包

学习小组Day6——学习R包

学习R包

安装加载R包

1.镜像的设置

• 解决R包在国外，下载慢的问题 1.初级模式：在Rstuidio程序中设置 Tools-Packages-Primary CRAN repositorry

2.高级模式——修改Rstudio配置文件

生信星球

2.安装

• 包可以从CRAN、Biocductor及Github下载安装，指令不同 CRAN:install.packages("包") Biocductor：BiocManager::install("包") Github：devtools::install_github()

3.加载

• library和require，两个函数均可

dplyr基础函数

1.arrange()排序

2.mutate()新增列或修改列

3.slect()、filter()筛选列、行

4.优秀的管道符%>%（传递）

5.summarise()汇总，一般与group_by()分组连用

表格的连接（dplyr包）

1.inner_join：交集

2.左连left_join和右连接right_join

• 左连接：左边有的保留，没有的去除 右连接：右边表格有的保留，没有的去除

3.全连接full_join

• 左右表格内有的都保留

4.semi_join半连接

• 以右边的表格为参照，左边表格有的就保留

5.anti_join反连接

• 去除右边表格有的，仅保留左表格独有的行

6.简单合并：bind_rows()和bind_cols()

• 1.相当于rbind(),cbind()，按行合并、按列合并 2.按行合并要求两表格有相同的列；按列合并要求两表格有相同的行