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学习小组day5笔记-R语言基础2

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清南
修改2023-04-13 19:21:13
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修改2023-04-13 19:21:13
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文章被收录于专栏:清南-我的生信入门笔记

昨天刚好把“R中的数据、逻辑和函数”这块儿空出来了,今天填进去✌ 今日份思维导图:

day5 R语言-数据结构
day5 R语言-数据结构

实操过程

1.给向量赋值&从向量中提取元素

代码语言:txt
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x<- c(1,2,3) #常用的向量写法,意为将x定义为由元素1,2,3组成的向量。
y<- 1:10  #从1-10之间所有的整数
z<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数(注意是逗号不是分号)
r<- rep(1:3,times=2)#1-3 重复2次
ls()
[1] "myPaths" "r"       "x"       "y"       "z"      
x
[1] 1 2 3
y
[1]  1  2  3  4  5  6  7  8  9 10
z
[1]  1.0  1.5  2.0  2.5  3.0  3.5  4.0  4.5  5.0  5.5  6.0  6.5  7.0  7.5  8.0  8.5
[17]  9.0  9.5 10.0
r
[1] 1 2 3 1 2 3
x[-1] #排除法,除了第1个元素之外剩余的元素
[1] 2 3
y[2:4] #第2到4个元素
[1] 2 3 4
r[-(1:3)] #除了第1-3个元素
[1] 1 2 3
z[c(1,10)] #第1个和第10个元素
[1] 1.0 5.5
x[x %in% c(1,2,5)] #存在于向量c(1,2,5)中的元素
[1] 1 2
z[z<2]
[1] 1.0 1.5
y[y==1]
[1] 1

2.数据框

read.csv,用于读取“comma separated value”文件。它以 DataFrame 的形式导入数据。相关参数:

file: 包含要导入到 R 中的数据的文件的路径。

header: 逻辑值。如果为 TRUE,则 read.csv() 假定您的文件具有标题行,因此第 1 行是每列的名称。如果不是这种情况,您可以添加参数 header = FALSE。

sep: 字段分隔符

dec: 文件中用于小数点的字符。

read.table,用于从文本文件中读取数据。它以表格的形式返回数据。相关参数 :

header: 表示文件是否包含标题行

sep: 表示文件中使用的分隔符值

代码语言:txt
复制
#数据框部分的操作,先在工作目录下新建qingnan.txt,并输入示例数据
X<-read.csv('qingnan.txt')
colnames(X)#查看列名
[1] "X1" "X2"
rownames(X) #查看行名
[1] "1" "2" "3" "4" "5"
read.table(file = "huahua.txt",sep = "\t",header =T) #从文本文件中读取数据,以表格的形式返回数据。
X1 X2
1  A  1
2  B NA
3  C NA
4  D  3
5  E NA
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号,字符串不加双引号(默认格式带由双引号) 
# 导出数据框之后可以在工作目录下找到一个新的yu.txt,
# 提取数据框中的元素(与提取向量中的元素大同小异,这里只记录了一下花花@生信星球总结的一些常用提取,没有实操。)
X[x,y] #第x行第y列
X[x,] #第x行
X[,y] #第y列
X[y]  #也是第y列
X[a:b] #第a列到第b列
X[c(a,b)] #第a列和第b列
X$列名 #也可以提取列(优秀写法,而且这个命令还优秀到不用写括号的地步,并且支持Tab自动补全哦,不过只能提取一列——补充:列名里带上循环是不是就可以提取多列了??)    

3.直接使用数据框中的变量:指定数据框,制定行、列,可以直接画散点图

代码语言:txt
复制
plot(iris$Sepal.Length,iris$Sepal.Width)

4.问题:save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found,是为什么,应该怎么解决?

答:object X not found 应该是因为 X 没有被定义/赋值,可能是之前定义过后删掉了,也有可能是大小写搞错了之类的,找到自己以为是 X 的那个向量或者数据框,检查一下它的名称、赋值,改好了再保存就行。

补充,关于 save 函数的说明:

如图,save函数可以将R对象的外部表示法写到指定的文件中,之后,可以通过load或attach(或data)从文件中读取这些对象。相关参数:

代码语言:txt
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* list: 一个包含要保存的对象名称的字符向量。
* file: 连接或保存数据的文件的名称。必须是保存的文件名。
* ascii: ASCII码,默认FALSE。
* envir: 寻找要保存的对象的环境。
* compress: 逻辑或字符串指定是否保存到指定文件是使用压缩。TRUE对应于gzip压缩,而字符串“gzip”、“bzip2”或“xz”指定压缩的类型。当文件是连接和工作空间格式版本时忽略
* save.image 只是“保存我当前工作空间”的捷径。(作者:谢俊飞,链接:https://www.jianshu.com/p/6d701d789ab2)
图片

原创声明:本文系作者授权腾讯云开发者社区发表,未经许可,不得转载。

如有侵权,请联系 cloudcommunity@tencent.com 删除。

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        • 4.问题:save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found,是为什么,应该怎么解决?
          • 补充,关于 save 函数的说明:
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