免疫沉淀 IP、免疫共沉淀 Co-IP 是解析蛋白表达水平、蛋白-蛋白相互作用的经典核心实验。该类实验的关键难点并不仅仅取决于抗体质量,更在于如何从成分复杂的细胞裂解液中高效、低背景地捕获抗体-抗原复合物。传统琼脂糖凝胶珠依靠离心完成固液分离,操作繁琐、耗时较长,还容易出现样本损失、背景偏高的问题。Protein A/G 磁珠(Protein A/G Magnetic Beads,AbMole,M124558)将重组融合 Protein A/G 蛋白共价偶联于超顺磁性磁珠微球表面,依靠磁场实现快速固液相分离,无需反复离心,能够高效捕获抗体 Fc 片段,是免疫沉淀、Co-IP、ChIP 等实验中广泛使用的固相富集工具。
Protein A/G 磁珠(Protein A/G Magnetic Beads,AbMole,M124558)是以超顺磁性微球为固相载体,表面共价交联重组 Protein A/G 融合蛋白的磁珠产品。天然的 Protein A 来源于金黄色葡萄球菌的细胞壁蛋白,可以结合抗体 IgG 的 Fc 尾部。对兔、人 IgG1/2/4 结合很好,但对小鼠 IgG1、大鼠、山羊的抗体结合能力弱,有一部分抗体抓不住;Protein G来源于 G 族链球菌的细胞壁蛋白,同样结合抗体 Fc 尾部。相比 Protein A,它适配的抗体范围更广,可以很好地结合小鼠 IgG1、大鼠、山羊、人 IgG3 这类 Protein A 抓得不好的抗体。Protein A/G磁珠表面偶联的是单一的重组融合蛋白(Protein A/G),一个蛋白分子上同时兼有 Protein A 和 Protein G 的 IgG 结合结构域,而不是两种独立蛋白混杂并存。这种方式集合了两个蛋白的优点,覆盖绝大多数物种、亚型的 IgG 抗体,兼容性最强。在外加磁场作用下,Protein A/G 磁珠(Protein A/G Magnetic Beads,AbMole,M124558)可快速聚集完成分离,洗涤、换液操作简便,既适用于普通离心管,也可适配 96 孔板实现高通量样本处理。
术语解释
超顺磁性是生物磁珠的特殊磁特性:只有放到外部磁铁(磁力架)旁边的时候,磁珠才会产生磁性、被磁铁吸附;一旦拿开磁铁,磁性立刻消失,磁珠互相之间不会互相吸在一起结块。
Protein A/G磁珠(Protein A/G Magnetic Beads,AbMole,M124558)通过表面融合蛋白特异性识别 IgG 抗体的 Fc 保守区,使抗体 Fab 抗原结合区域向外暴露,这样暴露的Fab 片段可以识别并结合样本内的靶抗原,形成 “磁珠-Protein A/G-抗体-抗原” 的复合物。孵育完成后,放置磁力架,磁珠会快速被磁场吸附于管壁,弃去包含杂蛋白的液相;经过多次洗涤,去除非特异性吸附的杂蛋白;最后洗脱液获取抗原-抗体复合物,用于后续 Western Blot 或者质谱检测。

首先,相比传统琼脂糖珠体系,Protein A/G 磁珠(Protein A/G Magnetic Beads,AbMole,M124558)依靠磁场完成分离,省去多次离心步骤,缩短样本处理时间,减少样本损耗,降低操作带来的实验误差。其次,重组融合 Protein A/G 兼顾 Protein A 与 Protein G 的抗体结合优势,适用抗体物种与亚型覆盖更广,无需针对不同来源抗体更换固相材料,通用性强。第三,磁珠微球粒径均匀,非特异性吸附水平低,能够有效降低杂蛋白背景,非常适合低丰度靶蛋白的富集,同时体系灵活:Protein A/G 磁珠(Protein A/G Magnetic Beads,AbMole,M124558)可兼容 96 孔板,满足大批量样本的筛选需求。
1. 免疫沉淀 IP 实验:从细胞或组织裂解液中富集内源靶蛋白,用于验证靶蛋白表达、翻译后修饰检测,如泛素化、磷酸化修饰鉴定。
2. 免疫共沉淀 Co-IP 实验:捕获抗原及其互作蛋白复合物,验证细胞内蛋白-蛋白相互作用。
3. 染色质免疫沉淀 ChIP 实验:结合特异性抗体捕获蛋白-DNA 复合物,研究转录因子与基因组 DNA 的结合关系。
4. 抗体富集与样本预处理:对血清、细胞培养上清样本中的特异性 IgG 抗体进行捕获富集。
5. 互作组质谱前样本制备:富集蛋白复合物,用于后续液相色谱-质谱联用,筛选未知互作分子。
以纯化血清类样品为例,操作步骤如下:
1.样品处理
取血清100µL(一般血清样品中抗体含量约2-8mg/mL)至1.5mL离心管中,加入900µL Binding/Washing Buffer,充分混匀。
2.磁珠预处理
1)充分混匀磁珠后,取200µL磁珠悬液到2mL离心管中,磁性分离,弃上清;
2)加入1mL Binding/Washing Buffer于离心管中,反复颠倒3-5次使磁珠充分重悬,磁性分离,弃上清;该步骤重复一次。
注:磁珠的用量可根据磁珠对目标抗体的最大结合量进行调节,可根据磁珠的抗体结合能力计算磁珠的大概用量,建议磁珠用量应为目标抗体含量的1.2-1.5倍。
3.抗体结合
在处理好的磁珠管中加入步骤1处理的样品溶液,振荡均匀,在室温下置于翻转混合仪或者手动轻轻翻转,使样品和磁珠充分接触混合结合15分钟,进行磁性分离,弃上清。
4.清洗磁珠
加入1mL的Binding/Washing Buffer 于离心管中,反复颠倒3-5次使磁珠充分重悬,磁性分离,弃上清;再重复该步骤2次。
5.目标抗体洗脱
1) 加入0.5-1mL Elution Buffer,室温下置于翻转混合仪或者手动轻轻翻转10分钟,置于磁力架上进行磁性分离,收集洗脱液到新的离心管中,即为纯化的目标抗体;
2) 若需要,可重复上述步骤,收集洗脱液至新离心管中,以检测目标抗体是否完全洗脱(Elution Buffer用量建议最终洗脱抗体浓度在0.5-1.2mg/mL,以确保一次洗脱可将95%以上的目标抗体被洗脱下来,用量过少会导致洗脱后仍有部分抗体残留于磁珠上)。
6.抗体中和
在以上含抗体的洗脱液中加入1/10抗体洗脱体积的Neutrilization Buffer,混匀使其pH值保持在中性环境下,以维持抗体的生物活性,避免失活。
磁珠后处理
1) 向装有磁珠的离心管中加入1mL Elution Buffer,涡旋震荡5s,磁性分离弃上清。重复操作2次;
2) 加入1mL Binding/Washing Buffer,涡旋 5s,磁性分离弃上清;重复操作2次;
3) 加入Storage Buffer 重悬磁珠,置于2-8℃保存。
磁珠再生
磁珠多次使用后会有沉淀蛋白、强疏水性蛋白、脂蛋白等杂质非特异性吸附到磁珠上,为了保证磁珠的使用效率,建议持续使用5次后进行磁珠再生处理。
1) 约每1mL(10mg/mL)磁珠加入1mL(1%,v/v)TrironX-100磁珠再生缓冲液,振荡均匀,在室温下置于翻转混合仪或者手动翻转混合10分钟后进行磁性分离,弃上清;
2) 加入1mL Binding/Washing Buffer 进行重悬,磁性分离,弃上清,重复该操作3次;
3) 加入1mL Storage Buffer 重悬磁珠,置于2-8℃保存。
流程优化
磁珠与抗体的结合效率与抗体的种属来源及所属亚型有关,请确认抗体的类型与Protein A/G 配基的亲和效率(附表):
1.如果抗体所属亚型与Protein A/G 的亲和度较低,可选择:a. 增加抗体与磁珠的孵育时间(30-120分钟);b. 提高结合缓冲液的pH值(8-9);c. 降低离子强度(25-100mM NaCl);d. 选择与目标抗体具有更高亲和度的配基(如Protein G或Protein A)等方法提高亲和效率。
2.如果抗体与Protein A/G配基亲和度太高导致抗体洗脱效率低,可选择:a.降低洗脱缓冲液的pH值1.9-2.5;b.增大洗脱缓冲液的离子强度(可选用 2-3M MgCl2);c.延长洗脱时间等方法提高洗脱效率。
注意事项
1.磁珠使用前应充分混匀,确保磁珠悬液处于均一状态。
2.磁珠使用后于保存液中储存2-8℃,避免冷冻或离心。
* 本文所述均为科研试剂,仅供科学研究使用
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