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社区首页 >问答首页 >如何在Linux中每隔一行对-unique进行排序?

如何在Linux中每隔一行对-unique进行排序?
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Stack Overflow用户
提问于 2018-07-26 06:18:44
回答 1查看 82关注 0票数 -1

我有一个FASTA文件,我只想去掉序列(偶数行)的冗余,而不是标题。

代码语言:javascript
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>headerX
**SEQUENCE1**
>headerY
SEQUENCE2
>headerZ
**SEQUENCE1**

我想去掉相同序列的(SEQUENCE1)

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回答 1

Stack Overflow用户

发布于 2018-07-26 07:07:41

您可以使用'sed‘来实现这一点,

代码语言:javascript
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sed -n 2~2p data.fasta  | sort -u

这将打印data.fasta中所有偶数编号的行,然后对结果进行排序以删除重复项。

票数 0
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页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/51528457

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