我试图循环遍历一个文本文件的行,这个文本文件确实是非空的,并且我的脚本遇到了问题。在我尝试调试我所写的内容时,我认为我可以确保我的脚本能够正确地从文件中读取,所以我目前正在尝试打印其中的每一行。
首先,我尝试使用Python中的常用方法来完成此操作,即:
with open('file.txt') as fo:
for line in fo:
print line
但是我的脚本没有打印任何东西。然后我尝试将所有行存储在一个列表中,如下所示:
with open('file.txt') as fo:
flines = fo.readlines()
print flines
然而,我的程序仍然输出一个空列表(即[]
)。在尝试读取文件之前,我还尝试使用fo.seek(0)
确保我的文件指针指向文件的开头,但同样不起作用。
我花了一些时间阅读这里发布的类似问题的解决方案,但到目前为止,我还没有尝试过任何解决方案。我不知道这样一个基本的I/O操作是如何给我带来这么多麻烦的,但我肯定遗漏了一些基本的东西,因此非常感谢任何帮助/建议。
编辑:这是我的脚本中导致问题的部分:
import subprocess as sbp
with open('conf_15000.xyz','w') as fo:
p1 =sbp.Popen(['head','-n', '300000','nnp-pos-1.xyz'],stdout=sbp.PIPE)
p2 = sbp.Popen(['tail','-n', '198'],stdin=p1.stdout,stdout=fo)
with open('conf_15000.xyz','r') as fp:
fp.seek(0)
flines = fp.readlines()
print flines
下面是nnp-pos-1.xyz
文件中的一段代码(所有行都具有相同的格式,总共有370642行):
Ti 32.9136715924 28.5387609200 24.6554922872
O 39.9997000300 35.1489480846 22.8396092714
O 33.7314699265 30.3398473499 23.8866085372
Ti 27.7756767925 31.3455930970 25.9779887743
O 31.1520937719 29.0752315770 25.4786577758
O 26.1870965535 32.4876155555 26.3346205619
Ti 38.4478275543 25.5734609650 22.0654953429
O 24.1328940232 31.3858060129 28.8575469919
O 38.6506317714 27.3779871011 22.6552032123
Ti 40.5617501289 27.5095900385 22.8436684314
O 38.2400600469 29.1828342919 20.7853056680
O 38.8481088254 27.2704154737 26.9590081202
当运行脚本时,从(conf_15000.xyz
)读取的文件被正确写入,但是我似乎无法在运行时读取它。
EDIT-2:遵循sudonym的建议,我使用绝对文件路径,并通过在我之前的编辑中编写的两个语句之间添加以下未缩进的with
行,在读取文件之前检查文件是否为空:
print os.path.isfile(r'full/path/to/file')
print (os.stat(r'full/path/to/file').st_size != 0)
第一个布尔值为True
(表示文件存在),而第二个布尔值为False
(表示文件为空)。这非常奇怪,因为这两行代码都是在我关闭写入文件的文件指针fo
之后添加的,还因为在我执行脚本之后,正在写入(随后使用fp
从其中读取)的文件不是空的(实际上,它包含了它应该包含的所有行)。
EDIT-3:我的脚本之所以看到它需要读取的文件是空的,是因为它没有等待写入它的子进程(在上面的例子中是p2
)停止执行,这意味着它会在文件指针实际关闭之前(即在文件写入完成之前)执行我的第一个with
语句之后的行。因此,修复方法是在第一个with
语句的末尾添加语句p2.wait()
,如下所示:
import subprocess as sbp
with open('conf_15000.xyz','w') as fo:
p1 =sbp.Popen(['head','-n', '300000','nnp-pos-1.xyz'],stdout=sbp.PIPE)
p2 = sbp.Popen(['tail','-n', '198'],stdin=p1.stdout,stdout=fo)
p2.wait()
with open('conf_15000.xyz','r') as fp:
fp.seek(0)
flines = fp.readlines()
print flines
现在,一切都按照它应该的方式工作。
发布于 2018-06-30 07:06:10
您可能需要首先对缓冲区执行flush()
操作(也许还需要调用os.fsync()
)-在写入之后和读取之前。
发布于 2018-06-30 05:14:20
首先,包含绝对路径。其次,检查文件是否实际存在且不为空:
import os
FILEPATH = r'path\to\file.txt' # full path as raw string
if os.path.isfile(FILEPATH) and (os.stat(FILEPATH).st_size != 0):
with open(FILEPATH) as fo:
flines = fo.readlines()
print flines
else:
print FILEPATH, "doesn't exist or is empty"
https://stackoverflow.com/questions/51109397
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