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社区首页 >问答首页 >无法在Ubuntu 13.04的R 3.0中安装rJava

无法在Ubuntu 13.04的R 3.0中安装rJava
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Stack Overflow用户
提问于 2013-05-08 18:15:31
回答 4查看 25.5K关注 0票数 54

我无法在R 3.0中调用rJava包。我收到了以下消息

代码语言:javascript
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Error: package ‘rJava’ was built before R 3.0.0: please re-install it

当我尝试重新安装rJava包时,我得到了错误。我已经提供了R CMD javareconf的输出

代码语言:javascript
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Java interpreter : /usr/bin/java
Java version     : 1.7.0_21
Java home path   : /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386/jre
Java compiler    : /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386/jre/../bin/javac
Java headers gen.: /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386/jre/../bin/javah
Java archive tool: /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-i386/jre/../bin/jar

trying to compile and link a JNI progam 
detected JNI cpp flags    : 
detected JNI linker flags : 
gcc -std=gnu99 -I/usr/share/R/include -DNDEBUG      -fpic  -O2 -pipe -g  -c conftest.c -o conftest.o
conftest.c:1:17: fatal error: jni.h: No such file or directory
compilation terminated.
make: *** [conftest.o] Error 1
Unable to compile a JNI program


Java library path: 
JNI cpp flags    : 
JNI linker flags : 
Updating Java configuration in /usr/lib/R
Done.

我使用的是Ubuntu 13.04。我也尝试了apt-get install r-cran-rjava,它对解决这个问题没有帮助。关于jni.h,有一些解决方案here.,但不确定我如何在这里使用该解决方案。

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回答 4

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2013-05-09 10:30:57

我遇到了完全相同的问题。我的解决方案是通过安装openjdk-7-*

代码语言:javascript
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sudo apt-get install openjdk-7-*

紧接着是

代码语言:javascript
复制
sudo R CMD javareconf

然后我就可以通过install.packages("rJava")在R中安装rJava了。

虽然这可能不是最优雅的解决方案,但它似乎已经解决了我让rJava正常工作的问题。

票数 76
EN

Stack Overflow用户

发布于 2014-02-02 06:12:34

对于那些得到错误的人:

代码语言:javascript
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error: unable to load shared object '/some/dir/rJava/libs/rJava.so': libjvm.so: 
cannot open shared object file: No such file or directory

我解决了在系统中定位库并将它们链接到/usr/lib的错误

代码语言:javascript
复制
$sudo updatedb
$locate libjvm.so
/usr/lib/debug/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so
/usr/lib/debug/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/zero/libjvm.so
/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/jamvm/libjvm.so
/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so
/usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/zero/libjvm.so
$sudo ln -s /usr/lib/jvm/java-7-openjdk-amd64/jre/lib/amd64/server/libjvm.so /usr/lib/ 
票数 27
EN

Stack Overflow用户

发布于 2017-08-30 05:10:04

按照this askUbuntu answer中的建议,从发行包安装rJava也是可行的:

代码语言:javascript
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sudo apt-get install r-cran-rjava

注意:在Debian系统中尝试过。

票数 2
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页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/16438073

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