问pdb蛋白质库格式-配体去除
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Stack Overflow用户

提问于 2011-10-08 02:44:34

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我想从PDB记录中删除各种配位符。这是否足以删除HET，HETNAM，HETATM...，即。这些，在哪里用它的3个字母的代码来标识复合，或者是否有必要清理一些其他字段？

有没有为此目的编写的python|perl脚本？

发布于 2012-01-06 21:10:51

open(FILE,"file.pdb");
@file=<FILE>;
foreach (@file){
if (/^HETATM/){
print $_,"\n";
}}

这就把配体分开了。要删除配体，请保持不等于regex的前面。

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原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/7691543

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