问将java应用程序数据冗余地存储在文件中的最好方法是什么？

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这完全取决于您存储的应用程序数据的类型。如果您需要重建java对象的原样(即变量和状态相同)，您可以序列化所需的对象。有许多序列化机制，例如您提到的xstream。如果你直接存储对象，使用这些机制中的一种就可以了。

但是，很多时候，您希望存储应用程序的状态，这不一定直接对应于直接序列化对象。如果是这样的话，你可以只写出你需要的相关数据。您使用的存储类型取决于您的需求。如果您有大量数据，请考虑数据库。在平面文件中，较小的数量可能工作得更好。

另一件事是，在单个文件中冗余地存储数据似乎没有太大用处。如果文件损坏，您将丢失两个副本，因此如果冗余是一个问题，请将其存储在不同的位置(即主数据库和备份数据库)。

没有一种正确的方法可以做到这一点，但希望这些想法能让你开始。