不同的Blast工具
不同的Blast工具
提问于 2011-05-05 23:17:05
我目前正在寻找商业与非商业爆炸工具。我已经多次使用NCBI blast进行本地blast搜索，但现在我正在寻找有趣的替代方案。在我的搜索过程中，我发现了一些有趣的结果，如CUDA-Blast，GPU-Blast，WU-Blast，BlastStation2，mpiBlast和Turboblast。有没有人使用过这些工具？或者，有没有类似的工具，比如BlastStation2，我错过了？有什么重要的商业或非商业blast工具我错过了吗？
我真的很感谢你的帮助。
谢谢,
Beeth
回答 2
Stack Overflow用户
发布于 2011-06-13 18:57:20
你可能想看看http://www.sequenceserver.com，它是开源的。它使得快速设置本地BLAST服务器变得非常容易，您可以将其连接到web界面。(这意味着你也可以与同事分享它)。
免责声明:我是开发者之一。
干杯,
Yannick
Stack Overflow用户
发布于 2012-03-02 21:40:56
您还应该看看FASTA程序，它们提供了相同的比较功能，等等。FASTA程序可以产生BLAST输出，因此分析管道只需要最少的修改。
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原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/5900159
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