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使用缝合MAF块时MAF类型为空(https://main.g2.bx.psu.edu/)
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Stack Overflow用户
提问于 2013-09-17 09:11:18
回答 1查看 121关注 0票数 0

我们使用https://main.g2.bx.psu.edu/上的银河缝合MAF块功能。

1)生成我的新组装的转录本的BED文件(基于人类参考基因组的坐标。下面称为"human_refseq_nooverlap_bed“的文件);

2)登录银河官网。获取数据->上传文件->文件格式:“床”,文件:点击选择"human_refseq_nooverlap_bed",基因组:"Human Feb. 2009 (GRCh37/hg19) (hg19)“

3) Fetch Alignment -> Stitch MAF blocks -> Stitch:"human_refseq_nooverlap_bed",MAF来源:"Locally Alignments";

4) MAF类型为空。你能帮我吗,谢谢。

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回答 1

Stack Overflow用户

发布于 2014-03-28 22:23:07

在您的床文件上,在编辑属性框中检查自动检测。然后再运行一次MAF,它应该可以工作!

票数 0
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页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/18839774

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