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问在plot.phylo中指定混凝土分支的宽度
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Stack Overflow用户

提问于 2015-04-19 22:19:48

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我想用3种不同的线宽在系统树上标记不同的分支。如何指定分支2具有width= 2，行10具有width= 4，其余行具有width=1？例如，bird.orders数据集中有88个分支

data(bird.orders)
bird.orders@edge

这显然不会做任何事情

plot(bird.orders, edge.width = c(bird.orders$edge[2]==2, bird.orders$edge[10]==4, bird.orders$edge[-c(2,10)]==1))

谢谢!

发布于 2015-04-22 16:44:01

首先，您需要弄清楚边的顺序，当plot.phylo()的参数方向设置为direction='leftwards'时，它显然遵循以下规则

<>G211

一旦获得了边缘的映射，就必须为每个分支构建一个具有所需宽度的向量。向量位置与边缘位置匹配。使用此问题中的示例，此代码将使分支1到5具有width=4，其余分支将采用默认宽度(1)：

plot(bird.orders, edge.width = c(4,4,4,4,4))

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原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/29731077

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