如何使用R删除值为0的行
如何使用R删除值为0的行
提问于 2013-08-05 18:20:46
我正在使用一个基因表达矩阵，frag计数来计算差异表达的基因。我想知道如何删除值为0的行。然后，我的数据集将是紧凑的，对于我使用此矩阵进行的下游分析，将给出较少的虚假结果。
输入
gene ZPT.1 ZPT.0 ZPT.2 ZPT.3 PDGT.1 PDGT.0
XLOC_000001 3516 626 1277 770 4309 9030
XLOC_000002 342 82 185 72 835 1095
XLOC_000003 2000 361 867 438 454 687
XLOC_000004 143 30 67 37 90 236
XLOC_000005 0 0 0 0 0 0
XLOC_000006 0 0 0 0 0 0
XLOC_000007 0 0 0 0 1 3
XLOC_000008 0 0 0 0 0 0
XLOC_000009 0 0 0 0 0 0
XLOC_000010 7 1 5 3 0 1
XLOC_000011 63 10 19 15 92 228期望输出
gene ZPT.1 ZPT.0 ZPT.2 ZPT.3 PDGT.1 PDGT.0
XLOC_000001 3516 626 1277 770 4309 9030
XLOC_000002 342 82 185 72 835 1095
XLOC_000003 2000 361 867 438 454 687
XLOC_000004 143 30 67 37 90 236
XLOC_000007 0 0 0 0 1 3
XLOC_000010 7 1 5 3 0 1
XLOC_000011 63 10 19 15 92 228到目前为止，我只想删除那些所有的分段计数列都是0的行，如果在任何行中，一些值是0，其他的值不是零，我希望保持该行完好无损，正如你可以看到我上面的例子。
请告诉我怎么做。
回答 2
Stack Overflow用户
回答已采纳
发布于 2013-08-05 18:29:55
df[apply(df[,-1], 1, function(x) !all(x==0)),]Stack Overflow用户
发布于 2021-07-19 15:22:59
在tidyverse中发布了许多这样做的选项：How to remove rows where all columns are zero using dplyr pipe
我的首选选择是使用按行()
library(tidyverse)
df <- df %>%
rowwise() %>%
filter(sum(c(col1,col2,col3)) != 0)页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/18055788
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