我有一个代码在我的电脑上使用依赖于mpi的Petsc。在我的电脑上它工作得很好。我把它放在集群上,导出gcc,Petsc和openmpi的路径(虽然我在电脑上用的是mpich,但我希望openmpi也能用)到LD_LIBRARY_PATH和PATH。我还更改了makefile中的路径。Petsc,gcc,openmpi都可以在集群上使用,所以我没有配置任何东西。当我执行make时,编译器给出了错误:
fatal error: mpi.h: No such file or directory
我知道我没有提供完整的信息,但如果需要的话,我可以告诉你更多。如何让Petsc知道mpi.h在哪里?
发布于 2015-12-10 02:05:36
通常,您应该使用mpicc (或C++的mpicxx )而不是gcc (或C++的g++ )进行编译。这些命令是gcc和g++的简单包装器,它们只是自动添加适当的-I/path/to/mpi/includes和-L/path/to/mpi/libs,应该包含在您的openmpi安装中。如果没有,只需在命令中添加-I/path/to/mpi/includes来编译适当的文件。这将告诉编译器在何处查找适当的头文件。
发布于 2018-05-25 05:33:30
来回答这个问题。为了防止C/C++编辑器在您键入“特殊代码”时显示错误,只需使用:
#include </usr/include/mpi/mpi.h>这似乎是一个链接--但这样做会关闭Netbeans编辑器中的错误,这样我就可以不受干扰地编写代码。注意:使用Ubuntu 18.04 Desktop作为编辑机器--并测试运行机器--但我使用mpic手动编译,如前所述。
sudo mpicc c_pi.c -o c_pi
and then...
mpiexec ./c_pihth
https://stackoverflow.com/questions/34185600
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