问使用两个js文件的相同脚本？

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实际上，将它们放在同一个文件中会有更好的性能--这取决于您的站点是如何构建的。其原则是减少http请求的数量，因为每个请求都会带来一些开销。

这就是说，这是最好的东西，留到生产的最后。在开发过程中，将所有内容分离会更容易。如果你打算加入他们，最好有一个自动化的构建脚本来执行操作。

将代码与不同的关注点分开通常是很好的。这两个文件可能来自不同的地方。假设prototype升级了，你想要新的优点。然后，您只需替换服务器上的prototype.js文件，而不是编辑庞大的文件并在其上进行手术。

编辑:对于浏览器来说，能够单独缓存文件也更“好”。如果你的问题来自于在几个html文件中复制代码块的问题，我建议你从服务器端制作一个代码片段，并通过手头上的任何方式将其包含在html文件中。

我很确定javascript不知道它是从哪个文件加载的，所以合并它应该不会有问题，但是……

就我个人而言，我会把它们分开。这将使协调版本控制等工作变得更简单。对于大多数重复访问，脚本无论如何都会被浏览器缓存，所以2对1并不是什么大问题。但当你升级其中一个(或另一个)时，客户端只需要下载一半的内容。但是，由于它通常是缓存的，所以这不是什么大问题！

因此，为了简单起见--保留脚本的原始形式。考虑到你的开场白“我不太了解javascript"，这是目前为止最好的方法；我并不是说贬低它--只是说如果有什么地方出了问题，你不想知道是不是你弄坏了它，或者它已经坏了。

编辑:它还使重新排序变得很容易，例如，如果您使用的两个脚本使用相同的术语，如jQuery中的$，它也支持带有显式命名的模式。