问有一个mySQL数据库非常慢，而其他数据库都很好

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我有一个mysql数据库，目前运行速度非常慢。服务器上有许多数据库，所有其他数据库都运行得很好，但是这个数据库非常慢，非常简单的更新(更新小表中的1行)或选择查询(从小表中选择1行)通常需要2-10秒。

我的问题是，是否有人能想出一个原因，为什么这个数据库运行得如此慢。流量很小(它是开发站点的数据库)。我已经排除了我的脚本，因为phpMyAdmin也非常慢，并且经常在使用这个数据库时超时。我还检查了正在运行的进程，以检查是否有任何异常，并且可能没有正在进行的进程，但数据库仍将运行得非常慢。

因此，请任何人对这里可能发生的事情做出一些解释。如果您需要的话，我很乐意提供额外的信息。

编辑：

在评论之后，下面是一个运行缓慢的查询的示例：

UPDATE `Users` SET `last active` = 1334763602 WHERE `ID` = 1

这个简单的更新查询需要2到10秒才能完成。ID是一个主键，这个表大约有30条记录。

对于我最初的问题，似乎SELECT没有那么糟糕，尽管我看到SELECT运行缓慢，但目前许多SELECT语句运行得很快，而UPDATE仍然很慢。

编辑2：

经过更多的调查，它似乎与InnoDB表类型有关。我已经将一个表更改为MyISAM，而在InnoDB中耗时1.5秒的查询在MyISAM中仅用了0.0006秒。我想我的问题是如何最好地调优到InnoDB表？