如何找出R中加载的是哪个包版本？
我正在研究如何使用我的大学集群。它安装了两个版本的R。系统范围的R 2.11 (Debian 6.0)和非标准位置的R 2.14.2。
我正在试着和雪一起使用MPI。我尝试运行的代码如下所示
library(snow)
library(Rmpi)
cl <- makeMPIcluster(mpi.universe.size()-1)
stopCluster(cl)
mpi.quit()它在R2.11上运行时没有问题。(我使用mpirun -H localhost,n1,n2,n3,n4 -n 1 R --slave -f code.R启动该脚本)。现在，当我尝试使用R 2.14.2来做这件事时，我得到以下消息：
Error: This is R 2.11.1, package 'snow' needs >= 2.12.1
In addition: Warning message:因此，R似乎加载了为R 2.11编译的包snow版本。我已经在我的主文件夹中安装了R 2.14下的snow，并在我的代码中添加了以下代码行：
.libPaths("/soft/R/lib/R/library")
.libPaths("~/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.11")
print(.libPaths())
print(sessionInfo())
print(version)错误之前的输出确认我确实在运行R 2.14.2，并且我的R packages文件夹位于搜索路径的第一位。但我还是得到了错误。
所以我的问题是，我如何确定在R中加载了哪个版本的包？我可以用installed.packages查看所有已安装的包，所以也许有一些函数可以列出已加载包的类似信息？
回答 12
Stack Overflow用户
发布于 2012-06-19 22:31:47
您可以使用sessionInfo()来完成此任务。
> sessionInfo()
R version 2.15.0 (2012-03-30)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
locale:
[1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8 LC_NUMERIC=C LC_TIME=en_US.UTF-8 LC_COLLATE=en_US.UTF-8
[5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8 LC_MESSAGES=en_US.UTF-8 LC_PAPER=C LC_NAME=C
[9] LC_ADDRESS=C LC_TELEPHONE=C LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C
attached base packages:
[1] graphics grDevices utils datasets stats grid methods base
other attached packages:
[1] ggplot2_0.9.0 reshape2_1.2.1 plyr_1.7.1
loaded via a namespace (and not attached):
[1] colorspace_1.1-1 dichromat_1.2-4 digest_0.5.2 MASS_7.3-18 memoise_0.1 munsell_0.3
[7] proto_0.3-9.2 RColorBrewer_1.0-5 scales_0.2.0 stringr_0.6
> 然而，根据下面的评论和答案，还有更好的选择
> packageVersion("snow")1‘0.3.9’
或者：
"Rmpi" %in% loadedNamespaces()Stack Overflow用户
发布于 2012-06-19 22:36:34
您可以使用utils::packageVersion查看安装的软件包的版本：
> packageVersion("snow")
[1] ‘0.3.9’除非包含包含有效
Version字段的DESCRIPTION文件，否则将找不到包。当没有找到软件包目录时，以及当有合适的目录但没有有效的DESCRIPTION文件时，会给出不同的警告。
虽然听起来你想看看你运行的是什么版本的R，但在这种情况下，@Justin's sessionInfo suggestion是最好的选择。
Stack Overflow用户
发布于 2016-05-22 08:07:36
从技术上讲，目前所有的答案都是错误的。packageVersion不返回加载的包的版本。它转到磁盘，并从那里获取包版本。
这在大多数情况下不会有什么不同，但有时会有所不同。据我所知，获取已加载包版本的唯一方法是：
asNamespace(pkg)$`.__NAMESPACE__.`$spec[["version"]]其中，pkg是包的名称。
编辑:我不确定这个函数是什么时候添加的，但你也可以使用getNamespaceVersion，这更简洁：
getNamespaceVersion(pkg)https://stackoverflow.com/questions/11103189
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